RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460573.5

C9orf3-209, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 443 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-209ENST00000460573 COG6Q9Y2V7 657 aa28.11■■■□□ 2.09
C9orf3-209ENST00000460573 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
C9orf3-209ENST00000460573 FSTL1Q12841 308 aa28.1■■■□□ 2.09
C9orf3-209ENST00000460573 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.09■■■□□ 2.09
C9orf3-209ENST00000460573 SMC1BQ8NDV3 1235 aa28.09■■■□□ 2.09
C9orf3-209ENST00000460573 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
C9orf3-209ENST00000460573 TAF1P21675 1872 aa28.07■■■□□ 2.08
C9orf3-209ENST00000460573 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.07■■■□□ 2.08
C9orf3-209ENST00000460573 MPHOSPH8Q99549 860 aa28.07■■■□□ 2.08
C9orf3-209ENST00000460573 TAF7LQ5H9L4 462 aa28.06■■■□□ 2.08
C9orf3-209ENST00000460573 MTX1Q13505 466 aa28.05■■■□□ 2.08
C9orf3-209ENST00000460573 OLFM4Q6UX06 510 aa28.04■■■□□ 2.08
C9orf3-209ENST00000460573 PSMD1Q99460 953 aa28.04■■■□□ 2.08
C9orf3-209ENST00000460573 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
C9orf3-209ENST00000460573 MPNDQ8N594 471 aa28.03■■■□□ 2.08
C9orf3-209ENST00000460573 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
C9orf3-209ENST00000460573 COL4A1P02462 1669 aa28.03■■■□□ 2.08
C9orf3-209ENST00000460573 SNED1Q8TER0 1413 aa28.02■■■□□ 2.08
C9orf3-209ENST00000460573 LRRC37AA6NMS7 1700 aa28.02■■■□□ 2.08
C9orf3-209ENST00000460573 WDR90Q96KV7 1748 aa28.02■■■□□ 2.08
C9orf3-209ENST00000460573 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 SUPT20HQ8NEM7 779 aa28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.01■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 DDNO94850 711 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 MINPP1Q9UNW1 487 aa28■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 SRGAP3O43295 1099 aa27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 JDP2Q8WYK2 163 aa27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 ANKRD2Q9GZV1 360 aa27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 VPS33BQ9H267 617 aa27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 FBXO3Q9UK99 471 aa27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 IARSP41252 1262 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 ATP8B2P98198 1209 aa27.98■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 CNNM1Q9NRU3 951 aa27.98■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa27.98■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 XDHP47989 1333 aa27.97■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 IQCA1LA6NCM1 817 aa27.97■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 GPSM2P81274 684 aa27.97■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 SLC51AQ86UW1 340 aa27.96■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.96■■■□□ 2.07
C9orf3-209ENST00000460573 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 COPRSQ9NQ92 184 aa27.95■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 SPEF2Q9C093 1822 aa27.95■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 ATP2B4P23634 1241 aa27.94■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 CHRNDQ07001 517 aa27.94■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 GGA1Q9UJY5 639 aa27.94■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa27.94■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 MROH5Q6ZUA9 1318 aa27.93■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 CEP85Q6P2H3 762 aa27.93■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 KLHDC4Q8TBB5 520 aa27.93■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 TBC1D16Q8TBP0 767 aa27.93■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 SSH3Q8TE77 659 aa27.93■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 EYA3Q99504 573 aa27.93■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 LEMD3Q9Y2U8 911 aa27.93■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.92■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 EYA2O00167 538 aa27.92■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 CIAO1O76071 339 aa27.92■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 EIF6P56537 245 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 AAMPQ13685 434 aa27.92■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 POLA2Q14181 598 aa27.92■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 LARGE2Q8N3Y3 721 aa27.92■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 CEP350Q5VT06 3117 aa27.92■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 SCN4AP35499 1836 aa27.91■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 C6orf229H3BNL8 230 aa27.91■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 HTRA3P83110 453 aa27.91■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 CRBNQ96SW2 442 aa27.91■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 POLLQ9UGP5 575 aa27.91■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 LTBP1Q14766 1721 aa27.91■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 ZNF541Q9H0D2 1346 aa27.91■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 POTECB2RU33 542 aa27.9■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 UFL1O94874 794 aa27.9■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 WASHC4Q2M389 1173 aa27.9■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 LRRC24Q50LG9 513 aa27.9■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 IL15P40933 162 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 KIAA2012Q0VF49 1180 aa27.89■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
C9orf3-209ENST00000460573 DUOX1Q9NRD9 1551 aa27.89■■■□□ 2.05
C9orf3-209ENST00000460573 PPIP5K2O43314 1243 aa27.88■■■□□ 2.05
C9orf3-209ENST00000460573 HMMRO75330 724 aa27.88■■■□□ 2.05
C9orf3-209ENST00000460573 CHADLQ6NUI6 762 aa27.88■■■□□ 2.05
C9orf3-209ENST00000460573 NIM1KQ8IY84 436 aa27.88■■■□□ 2.05
C9orf3-209ENST00000460573 HACL1Q9UJ83 578 aa27.88■■■□□ 2.05
C9orf3-209ENST00000460573 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
C9orf3-209ENST00000460573 GJA3Q9Y6H8 435 aa27.88■■■□□ 2.05
C9orf3-209ENST00000460573 KCNJ4P48050 445 aa27.87■■■□□ 2.05
C9orf3-209ENST00000460573 METTL24Q5JXM2 366 aa27.87■■■□□ 2.05
C9orf3-209ENST00000460573 ATG9AQ7Z3C6 839 aa27.87■■■□□ 2.05
C9orf3-209ENST00000460573 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
C9orf3-209ENST00000460573 SIL1Q9H173 461 aa27.87■■■□□ 2.05
C9orf3-209ENST00000460573 CLEC11AQ9Y240 323 aa27.87■■■□□ 2.05
C9orf3-209ENST00000460573 ZNF804BA4D1E1 1349 aa27.87■■■□□ 2.05
C9orf3-209ENST00000460573 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms