RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454540.5

BBX-216, Transcript of BBX, HMG-box containing, humanhuman

TSL 5

Gene BBX, Length 392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBX-216ENST00000454540 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
BBX-216ENST00000454540 EYA3Q99504 573 aa26.72■■□□□ 1.87
BBX-216ENST00000454540 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
BBX-216ENST00000454540 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.7■■□□□ 1.86
BBX-216ENST00000454540 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26.69■■□□□ 1.86
BBX-216ENST00000454540 COL4A1P02462 1669 aa26.69■■□□□ 1.86
BBX-216ENST00000454540 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
BBX-216ENST00000454540 FAM89AQ96GI7 184 aa26.68■■□□□ 1.86
BBX-216ENST00000454540 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
BBX-216ENST00000454540 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.67■■□□□ 1.86
BBX-216ENST00000454540 TBC1D8O95759 1140 aa26.67■■□□□ 1.86
BBX-216ENST00000454540 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
BBX-216ENST00000454540 SCARF1Q14162 830 aa26.67■■□□□ 1.86
BBX-216ENST00000454540 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
BBX-216ENST00000454540 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.67■■□□□ 1.86
BBX-216ENST00000454540 SCN9AQ15858 1988 aa26.66■■□□□ 1.86
BBX-216ENST00000454540 FKBP1BP68106 108 aa26.66■■□□□ 1.86
BBX-216ENST00000454540 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
BBX-216ENST00000454540 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
BBX-216ENST00000454540 MOB2Q70IA6 237 aa26.65■■□□□ 1.86
BBX-216ENST00000454540 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.65■■□□□ 1.86
BBX-216ENST00000454540 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
BBX-216ENST00000454540 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.63■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 RIPK4P57078 832 aa26.63■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.63■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa26.63■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 UBE2Q2LH0YL09 131 aa26.62■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 KRT24Q2M2I5 525 aa26.62■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.62■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.62■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 G3V3G9 751 aa26.61■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.61■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.61■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 ZNF609O15014 1411 aa26.6■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 GPR25O00155 361 aa26.6■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 UFL1O94874 794 aa26.6■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.6■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 GMLQ99445 158 aa26.6■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 TM4SF4P48230 202 aa26.59■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa26.59■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa26.58■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 MYOZ2Q9NPC6 264 aa26.58■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.58■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 GGA1Q9UJY5 639 aa26.58■■□□□ 1.85
BBX-216ENST00000454540 USP17L8P0C7I0 530 aa26.57■■□□□ 1.84
BBX-216ENST00000454540 GCC1Q96CN9 775 aa26.57■■□□□ 1.84
BBX-216ENST00000454540 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.57■■□□□ 1.84
BBX-216ENST00000454540 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
BBX-216ENST00000454540 CHL1O00533 1208 aa26.54■■□□□ 1.84
BBX-216ENST00000454540 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
BBX-216ENST00000454540 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa26.54■■□□□ 1.84
BBX-216ENST00000454540 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
BBX-216ENST00000454540 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
BBX-216ENST00000454540 FKTNO75072 461 aa26.52■■□□□ 1.84
BBX-216ENST00000454540 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.52■■□□□ 1.84
BBX-216ENST00000454540 NBPF9Q3BBW0 867 aa26.52■■□□□ 1.84
BBX-216ENST00000454540 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
BBX-216ENST00000454540 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.52■■□□□ 1.84
BBX-216ENST00000454540 USP17L3A6NCW0 530 aa26.51■■□□□ 1.83
BBX-216ENST00000454540 USP17L4A6NCW7 530 aa26.51■■□□□ 1.83
BBX-216ENST00000454540 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.51■■□□□ 1.83
BBX-216ENST00000454540 CFHR5Q9BXR6 569 aa26.51■■□□□ 1.83
BBX-216ENST00000454540 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
BBX-216ENST00000454540 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
BBX-216ENST00000454540 PSME4Q14997 1843 aa26.5■■□□□ 1.83
BBX-216ENST00000454540 SREBF2Q12772 1141 aa26.48■■□□□ 1.83
BBX-216ENST00000454540 PODNQ7Z5L7 613 aa26.48■■□□□ 1.83
BBX-216ENST00000454540 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
BBX-216ENST00000454540 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
BBX-216ENST00000454540 HYPKQ9NX55 129 aa26.47■■□□□ 1.83
BBX-216ENST00000454540 XDHP47989 1333 aa26.46■■□□□ 1.83
BBX-216ENST00000454540 HOXB7P09629 217 aa26.46■■□□□ 1.83
BBX-216ENST00000454540 NF2P35240 595 aa26.46■■□□□ 1.83
BBX-216ENST00000454540 MXD3Q9BW11 206 aa26.46■■□□□ 1.83
BBX-216ENST00000454540 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
BBX-216ENST00000454540 WNT10BO00744 389 aa26.45■■□□□ 1.82
BBX-216ENST00000454540 ATP2B4P23634 1241 aa26.45■■□□□ 1.82
BBX-216ENST00000454540 NEUROD2Q15784 382 aa26.45■■□□□ 1.82
BBX-216ENST00000454540 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.45■■□□□ 1.82
BBX-216ENST00000454540 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
BBX-216ENST00000454540 POTEFA5A3E0 1075 aa26.44■■□□□ 1.82
BBX-216ENST00000454540 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
BBX-216ENST00000454540 PRKG1Q13976 671 aa26.43■■□□□ 1.82
BBX-216ENST00000454540 DACT2Q5SW24 774 aa26.43■■□□□ 1.82
BBX-216ENST00000454540 SPRYD7Q5W111 196 aa26.43■■□□□ 1.82
BBX-216ENST00000454540 ARMC9Q7Z3E5 817 aa26.43■■□□□ 1.82
BBX-216ENST00000454540 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.43■■□□□ 1.82
BBX-216ENST00000454540 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.43■■□□□ 1.82
BBX-216ENST00000454540 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
BBX-216ENST00000454540 PDE8AO60658 829 aa26.42■■□□□ 1.82
BBX-216ENST00000454540 LDLRAD1Q5T700 205 aa26.42■■□□□ 1.82
BBX-216ENST00000454540 TRIM17Q9Y577 477 aa26.42■■□□□ 1.82
BBX-216ENST00000454540 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
BBX-216ENST00000454540 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.41■■□□□ 1.82
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