RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445427.1

PRKCQ-AS1-202, PRKCQ antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCQ-AS1, Length 1,133 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CHMP3Q9Y3E7 222 aa27.31■■□□□ 1.96
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MPHOSPH8Q99549 860 aa27.3■■□□□ 1.96
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 APLP1P51693 650 aa27.22■■□□□ 1.95
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LEMD3Q9Y2U8 911 aa27.21■■□□□ 1.95
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PSME4Q14997 1843 aa27.14■■□□□ 1.94
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DPF2Q92785 391 aa27.13■■□□□ 1.93
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa27.09■■□□□ 1.93
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 USP17L3A6NCW0 530 aa27.08■■□□□ 1.93
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 USP17L4A6NCW7 530 aa27.08■■□□□ 1.93
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PLIN1O60240 522 aa27.08■■□□□ 1.93
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 KLRK1P26718 216 aa27.08■■□□□ 1.93
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 USP17L1Q7RTZ2 530 aa27.08■■□□□ 1.93
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TXNRD3Q86VQ6 643 aa27.08■■□□□ 1.93
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CNTROBQ8N137 903 aa27.07■■□□□ 1.92
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