RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445020.1

KNOP1P4-201, Transcript of lysine rich nucleolar protein 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene KNOP1P4, Length 1,438 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1P4-201ENST00000445020 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.66□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.65□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.65□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.65□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 NEFLP07196 543 aa14.65□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.65□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.65□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.65□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.65□□□□□ -0.06
KNOP1P4-201ENST00000445020 EYA2O00167 538 aa14.64□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 PSMD1Q99460 953 aa14.64□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 XDHP47989 1333 aa14.64□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 C21orf2O43822 256 aa14.63□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa14.63□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.63□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.63□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 EXOC6Q8TAG9 804 aa14.63□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 VPS33BQ9H267 617 aa14.63□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.63□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.63□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 MPNDQ8N594 471 aa14.62□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.62□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.62□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 GPR162Q16538 588 aa14.61□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 ATP2B4P23634 1241 aa14.6□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 CHRNDQ07001 517 aa14.6□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.6□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 SIRT2Q8IXJ6 389 aa14.6□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.6□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa14.6□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 SCN9AQ15858 1988 aa14.6□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.59□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.59□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.59□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.59□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 MED23Q9ULK4 1368 aa14.59□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 RAB11FIP3O75154 756 aa14.58□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 PDE8BO95263 885 aa14.58□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 UBE4AQ14139 1066 aa14.58□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 METTL24Q5JXM2 366 aa14.58□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.58□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 EYA3Q99504 573 aa14.58□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 GGA1Q9UJY5 639 aa14.58□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
KNOP1P4-201ENST00000445020 NFKBIEO00221 500 aa14.58□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 GPSM2P81274 684 aa14.58□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 LRRC24Q50LG9 513 aa14.58□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 POTEDQ86YR6 584 aa14.58□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.58□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 DCTPP1Q9H773 170 aa14.58□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 GPR108Q9NPR9 543 aa14.58□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.58□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.58□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 MYH7P12883 1935 aa14.57□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.57□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 AK9Q5TCS8 1911 aa14.57□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 SIL1Q9H173 461 aa14.57□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.57□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 ZNF609O15014 1411 aa14.56□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 ZBTB22O15209 634 aa14.56□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 UFL1O94874 794 aa14.56□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 LMNB1P20700 586 aa14.56□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 OLFM4Q6UX06 510 aa14.56□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.56□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 GCC1Q96CN9 775 aa14.56□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 KIF1BPQ96EK5 621 aa14.56□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 SASH1O94885 1247 aa14.55□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 KCNJ4P48050 445 aa14.55□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.55□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 LPIN2Q92539 896 aa14.55□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 POLLQ9UGP5 575 aa14.55□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 SCN4AP35499 1836 aa14.55□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 C6orf229H3BNL8 230 aa14.54□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 FGFR2P21802 821 aa14.54□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 WASHC4Q2M389 1173 aa14.54□□□□□ -0.08
KNOP1P4-201ENST00000445020 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms