RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 FBF1Q8TES7 1133 aa12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP63Q96MT8 703 aa12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 HYPKQ9NX55 129 aa12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 UBR1Q8IWV7 1749 aa12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC171Q6TFL3 1326 aa12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 MNAT1P51948 309 aa12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM67Q5HYA8 995 aa12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 ISM2Q6H9L7 571 aa12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 GIMAP6Q6P9H5 292 aa12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 HMG20BQ9P0W2 317 aa12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 TMOD3Q9NYL9 352 aa12.6□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 QRICH2Q9H0J4 1663 aa12.6□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLIM4O00461 696 aa12.6□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 ACTN2P35609 894 aa12.6□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa12.6□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa12.6□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 SKILP12757 684 aa12.6□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 LRSAM1Q6UWE0 723 aa12.6□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 PPM1EQ8WY54 764 aa12.6□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 DRC1Q96MC2 740 aa12.6□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 SPAG5Q96R06 1193 aa12.6□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPRMP28827 1452 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA0753Q2KHM9 967 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM47Q96LD4 638 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 SNRKQ9NRH2 765 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFYVE9O95405 1425 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 SYKP43405 635 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 UBASH3AP57075 661 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 SPAG1Q07617 926 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 C6orf163Q5TEZ5 329 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 PRC1O43663 620 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP12.59□□□□□ -0.396e-8■□□□□ 10.7
EFTUD2-202ENST00000426333 HAND2P61296 217 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 IDI1Q13907 227 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC186Q7Z3E2 898 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM200AQ8TCP9 573 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 TMX3Q96JJ7 454 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 TIGD1Q96MW7 591 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 PLVAPQ9BX97 442 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC21AQ8NDW8 1320 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 CLCN1P35523 988 aa12.58□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 NCOA7Q8NI08 942 aa12.58□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 BRF1Q92994 677 aa12.58□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAI1Q9UI46 699 aa12.58□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa12.58□□□□□ -0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 LIG1P18858 919 aa12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP12.58□□□□□ -0.43e-6■■■■□ 26
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 NME9Q86XW9 330 aa12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 SLF2Q8IX21 1173 aa12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 A2ML1A8K2U0 1454 aa12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 CTAGE15A4D2H0 777 aa12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPY2A6NKD2 308 aa12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 PPFIA3O75145 1194 aa12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 ZPR1O75312 459 aa12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 LDHCP07864 332 aa12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 CTAGE8P0CG41 777 aa12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM25P49756 843 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 MCM6Q14566 821 aa12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC22Q5TAA0 569 aa12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 CTAGE6Q86UF2 777 aa12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 CTAGE4Q8IX94 777 aa12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa12.57□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC26A6Q9BXS9 759 aa12.57□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 HSF2BPO75031 334 aa12.57□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 HSPA4P34932 840 aa12.57□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 CHMP4BP1P59074 171 aa12.57□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC155Q8N6L0 562 aa12.57□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 GPATCH11Q8N954 259 aa12.57□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC27Q9C0I9 530 aa12.57□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 EHMT1Q9H9B1 1298 aa12.57□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 IKBKGQ9Y6K9 419 aa12.57□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 MFSD6Q6ZSS7 791 aa12.57□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 WAPLQ7Z5K2 1190 aa12.57□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 COMMD10Q9Y6G5 202 aa12.57□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 BMP15O95972 392 aa12.56□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC172P0C7W6 258 aa12.56□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 PDE4BQ07343 736 aa12.56□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa12.56□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 SYCP3Q8IZU3 236 aa12.56□□□□□ -0.4
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNG4Q8TDN1 519 aa12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms