RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422344.5

TRAF4-204, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 3

Gene TRAF4, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-204	ENST00000422344	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	COL4A1	P02462	1669 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	C6orf229	H3BNL8	230 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	GPSM2	P81274	684 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	BEND3	Q5T5X7	828 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	MYH3	P11055	1940 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	WASHC4	Q2M389	1173 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	EYA3	Q99504	573 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	GREM2	Q9H772	168 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	RTL9	Q8NET4	1388 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
TRAF4-204	ENST00000422344	TRAF5	O00463	557 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	CASP7	P55210	303 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	RIMBP2	O15034	1052 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	ALDH1L1	O75891	902 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	POLL	Q9UGP5	575 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	PTPRC	P08575	1304 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	UFL1	O94874	794 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	CXCL9	Q07325	125 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	GRM1	Q13255	1194 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	CST9	Q5W186	159 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	CAPNS2	Q96L46	248 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	GGA1	Q9UJY5	639 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	GRM8	O00222	908 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	XDH	P47989	1333 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	ITGA6	P23229	1130 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	ECE1	P42892	770 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	TNIP1	Q15025	636 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	FAM161A	Q3B820	660 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344		G3V3G9	751 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	RAD17	O75943	681 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TRAF4-204	ENST00000422344	CSF1R	P07333	972 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	SPEF2	Q9C093	1822 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	ATP2B4	P23634	1241 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	DOK7	Q18PE1	504 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	YDJC	A8MPS7	323 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	ECE2	O60344	883 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	FOXO4	P98177	505 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	27.66	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	ABHD8	Q96I13	439 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	AOC2	O75106	756 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TRAF4-204	ENST00000422344	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
TRAF4-204	ENST00000422344	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
TRAF4-204	ENST00000422344	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TRAF4-204	ENST00000422344	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TRAF4-204	ENST00000422344	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TRAF4-204	ENST00000422344	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TRAF4-204	ENST00000422344	PSMD14	O00487	310 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TRAF4-204	ENST00000422344	MAP2K2	P36507	400 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TRAF4-204	ENST00000422344	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TRAF4-204	ENST00000422344	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TRAF4-204	ENST00000422344	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
TRAF4-204	ENST00000422344	KCNJ4	P48050	445 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TRAF4-204	ENST00000422344	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		27.6	■■■□□ 2.01

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