RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420058.1

NFE4-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NFE4, Length 1,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE4-201ENST00000420058 RPS12P25398 132 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
NFE4-201ENST00000420058 RPS8P62241 208 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
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NFE4-201ENST00000420058 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
NFE4-201ENST00000420058 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa18.6■□□□□ 0.57
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NFE4-201ENST00000420058 SEC31BQ9NQW1 1179 aa18.59■□□□□ 0.57
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NFE4-201ENST00000420058 TRPA1O75762 1119 aa18.55■□□□□ 0.56
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NFE4-201ENST00000420058 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
NFE4-201ENST00000420058 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
NFE4-201ENST00000420058 MBIPQ9NS73 344 aa18.53■□□□□ 0.56
NFE4-201ENST00000420058 UFL1O94874 794 aa18.52■□□□□ 0.56
NFE4-201ENST00000420058 SCARF1Q14162 830 aa18.52■□□□□ 0.56
NFE4-201ENST00000420058 SULF1Q8IWU6 871 aa18.52■□□□□ 0.56
NFE4-201ENST00000420058 ZNF609O15014 1411 aa18.51■□□□□ 0.55
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NFE4-201ENST00000420058 RASAL3Q86YV0 1011 aa18.5■□□□□ 0.55
NFE4-201ENST00000420058 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa18.5■□□□□ 0.55
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NFE4-201ENST00000420058 USP17L8P0C7I0 530 aa18.47■□□□□ 0.55
NFE4-201ENST00000420058 CCDC152Q4G0S7 254 aa18.47■□□□□ 0.55
NFE4-201ENST00000420058 MYOZ2Q9NPC6 264 aa18.47■□□□□ 0.55
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NFE4-201ENST00000420058 USP17L4A6NCW7 530 aa18.45■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 G3V3G9 751 aa18.45■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 UBE2Q2LH0YL09 131 aa18.45■□□□□ 0.54
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NFE4-201ENST00000420058 USP17L1Q7RTZ2 530 aa18.45■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 PODNQ7Z5L7 613 aa18.45■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
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NFE4-201ENST00000420058 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa18.45■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 AKAP11Q9UKA4 1901 aa18.45■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 IGKV5-2P06315 115 aa18.44■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 ATP2B4P23634 1241 aa18.44■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 IFT57Q9NWB7 429 aa18.44■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 DACT2Q5SW24 774 aa18.43■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa18.43■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 TTLL11Q8NHH1 800 aa18.43■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 MINPP1Q9UNW1 487 aa18.43■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 HTTP42858 3142 aa18.43■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 PSME4Q14997 1843 aa18.42■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 APAF1O14727 1248 aa18.42■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 TXNRD3Q86VQ6 643 aa18.42■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 HPS5Q9UPZ3 1129 aa18.42■□□□□ 0.54
NFE4-201ENST00000420058 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
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