RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417464.6

UPP1-205, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 782 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-205ENST00000417464 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.52■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 CSF1RP07333 972 aa24.52■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 EPHX2P34913 555 aa24.52■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 VPS33BQ9H267 617 aa24.52■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 KCNQ5Q9NR82 932 aa24.52■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.52■■□□□ 1.52
UPP1-205ENST00000417464 EPS15P42566 896 aa24.51■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 GGA1Q9UJY5 639 aa24.51■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 ALDH1L1O75891 902 aa24.5■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.5■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 SUCLG2Q96I99 432 aa24.5■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.5■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.5■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 PTPRCP08575 1304 aa24.5■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 SHTN1A0MZ66 631 aa24.49■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 ECE2O60344 883 aa24.49■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.49■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 XDHP47989 1333 aa24.48■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.48■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 KAZALD1Q96I82 304 aa24.48■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 SCN4AP35499 1836 aa24.47■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 CHADLQ6NUI6 762 aa24.47■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 APLP1P51693 650 aa24.46■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 EYA3Q99504 573 aa24.46■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 CLEC11AQ9Y240 323 aa24.46■■□□□ 1.51
UPP1-205ENST00000417464 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.45■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 SNAP23O00161 211 aa24.45■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 PSMD14O00487 310 aa24.45■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 KLRK1P26718 216 aa24.45■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 LDHDQ86WU2 507 aa24.45■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.44■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 GPRC5DQ9NZD1 345 aa24.44■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa24.44■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 ATP2B4P23634 1241 aa24.43■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 TNNQ9UQP3 1299 aa24.43■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 UTYO14607 1347 aa24.42■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.42■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 TAF5LO75529 589 aa24.41■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 BCAR3O75815 825 aa24.41■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 CHRNDQ07001 517 aa24.41■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 TNIP1Q15025 636 aa24.41■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.41■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 USP44Q9H0E7 712 aa24.41■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 SCN9AQ15858 1988 aa24.41■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 G3V3G9 751 aa24.4■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.4■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 TRPM4Q8TD43 1214 aa24.4■■□□□ 1.5
UPP1-205ENST00000417464 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.39■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.38■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 MICALL2Q8IY33 904 aa24.38■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.38■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 MED23Q9ULK4 1368 aa24.38■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.37■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 PLIN1O60240 522 aa24.37■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 EGFRP00533 1210 aa24.37■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 MXD3Q9BW11 206 aa24.37■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 CNTROBQ8N137 903 aa24.36■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.36■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.36■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 PASKQ96RG2 1323 aa24.35■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 KCNJ4P48050 445 aa24.35■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.35■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 SAMD7Q7Z3H4 446 aa24.35■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.35■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.35■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.35■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 A0A1B0GUL6 1792 aa24.34■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 TRAF5O00463 557 aa24.34■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 FBXW7Q969H0 707 aa24.34■■□□□ 1.49
UPP1-205ENST00000417464 KIF16BQ96L93 1317 aa24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms