RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416453.6

GTF3C2-AS1-201, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GTF3C2-AS1, Length 863 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UTYO14607 1347 aa12.92□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KDM2BQ8NHM5 1336 aa12.92□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CSF1RP07333 972 aa12.92□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LARGE2Q8N3Y3 721 aa12.92□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GLTPD2A6NH11 291 aa12.91□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRIM27P14373 513 aa12.91□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCT4P50991 539 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LMBR1LQ6UX01 489 aa12.91□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SUPT20HQ8NEM7 779 aa12.91□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KAZALD1Q96I82 304 aa12.91□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa12.9□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PITPNM1O00562 1244 aa12.9□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KIF3CO14782 793 aa12.9□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UFL1O94874 794 aa12.9□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NIM1KQ8IY84 436 aa12.9□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 JDP2Q8WYK2 163 aa12.9□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 USP44Q9H0E7 712 aa12.9□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 POLLQ9UGP5 575 aa12.9□□□□□ -0.34
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C6orf229H3BNL8 230 aa12.89□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FZD9O00144 591 aa12.89□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DDNO94850 711 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KIAA2012Q0VF49 1180 aa12.89□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa12.89□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ANKRD44Q8N8A2 993 aa12.89□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TBC1D16Q8TBP0 767 aa12.89□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ARHGAP45Q92619 1136 aa12.89□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CLUAP1Q96AJ1 413 aa12.89□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RRAGCQ9HB90 399 aa12.89□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa12.89□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CLEC11AQ9Y240 323 aa12.89□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SCN4AP35499 1836 aa12.89□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SCN9AQ15858 1988 aa12.89□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 XDHP47989 1333 aa12.88□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PSME4Q14997 1843 aa12.88□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RIMBP2O15034 1052 aa12.88□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa12.88□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DPY19L2Q6NUT2 758 aa12.88□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MPHOSPH8Q99549 860 aa12.88□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MEIS3Q99687 375 aa12.88□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PODXL2Q9NZ53 605 aa12.88□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GGA1Q9UJY5 639 aa12.88□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MINPP1Q9UNW1 487 aa12.88□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 EIF6P56537 245 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 WASHC4Q2M389 1173 aa12.87□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCDC57Q2TAC2 916 aa12.87□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TAF7LQ5H9L4 462 aa12.87□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DBNDD1Q9H9R9 158 aa12.87□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GJA3Q9Y6H8 435 aa12.87□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CHRNDQ07001 517 aa12.86□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TMEM57Q8N5G2 664 aa12.86□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 EYA3Q99504 573 aa12.86□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 VPS33BQ9H267 617 aa12.86□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MED23Q9ULK4 1368 aa12.85□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 YDJCA8MPS7 323 aa12.85□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 POTECB2RU33 542 aa12.85□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ATP2B4P23634 1241 aa12.85□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DOK7Q18PE1 504 aa12.85□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GPC2Q8N158 579 aa12.85□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNRF3Q9ULT6 936 aa12.85□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa12.84□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ECE2O60344 883 aa12.84□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RAD17O75943 681 aa12.84□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RLBP1P12271 317 aa12.84□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KLRK1P26718 216 aa12.84□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C1QTNF8P60827 252 aa12.84□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KLHDC4Q8TBB5 520 aa12.84□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CNNM1Q9NRU3 951 aa12.84□□□□□ -0.35
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SNAP23O00161 211 aa12.83□□□□□ -0.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TAF5LO75529 589 aa12.83□□□□□ -0.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NEFLP07196 543 aa12.83□□□□□ -0.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KCNJ4P48050 445 aa12.83□□□□□ -0.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CXCL9Q07325 125 aa12.83□□□□□ -0.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa12.83□□□□□ -0.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ANKRD2Q9GZV1 360 aa12.83□□□□□ -0.36
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RCAN3Q9UKA8 241 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms