RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 MXD3Q9BW11 206 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLSPNQ9HAW4 1339 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 UBE2Q2LH0YL09 131 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 H7C1D1 291 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 TNIP1Q15025 636 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.19□□□□□ -1.26
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RNU6-171P-201ENST00000384354 COPS6Q7L5N1 327 aa7.19□□□□□ -1.26
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RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM89AQ96GI7 184 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 VPS33BQ9H267 617 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 SSC5DA1L4H1 1573 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 ALPK3Q96L96 1907 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.18□□□□□ -1.26
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RNU6-171P-201ENST00000384354 SCARF1Q14162 830 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 NFE2L2Q16236 605 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 WASHC4Q2M389 1173 aa7.18□□□□□ -1.26
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RNU6-171P-201ENST00000384354 DPF2Q92785 391 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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RNU6-171P-201ENST00000384354 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 SH3TC1Q8TE82 1336 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF609O15014 1411 aa7.18□□□□□ -1.26
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RNU6-171P-201ENST00000384354 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
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RNU6-171P-201ENST00000384354 CFAP53Q96M91 514 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 AOX1Q06278 1338 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 ERBB4Q15303 1308 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 LAMA3Q16787 3333 aa7.16□□□□□ -1.26
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RNU6-171P-201ENST00000384354 UFL1O94874 794 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRKG1Q13976 671 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 SULF1Q8IWU6 871 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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RNU6-171P-201ENST00000384354 SASH1O94885 1247 aa7.15□□□□□ -1.26
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RNU6-171P-201ENST00000384354 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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RNU6-171P-201ENST00000384354 EN2P19622 333 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 GJA5P36382 358 aa7.14□□□□□ -1.27
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RNU6-171P-201ENST00000384354 OTOP1Q7RTM1 612 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 TXNRD3Q86VQ6 643 aa7.14□□□□□ -1.27
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RNU6-171P-201ENST00000384354 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYOZ2Q9NPC6 264 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 HDAC9Q9UKV0 1011 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 UNC80Q8N2C7 3258 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 DOCK3Q8IZD9 2030 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 EYSQ5T1H1 3165 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 WNT10BO00744 389 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 TM4SF4P48230 202 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLMNQ96JQ2 1002 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 FKTNO75072 461 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPS8P62241 208 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 DACT2Q5SW24 774 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 CD99L2Q8TCZ2 262 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIM17Q9Y577 477 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 CUL9Q8IWT3 2517 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNAP23O00161 211 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP17L8P0C7I0 530 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMPOP42166 694 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 RIPK4P57078 832 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-171P-201ENST00000384354 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
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