RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377689.2

FAM220BP-201, Transcript of family with sequence similarity 220 member B, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene FAM220BP, Length 816 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220BP-201ENST00000377689 NFKBIEO00221 500 aa20.4■□□□□ 0.86
FAM220BP-201ENST00000377689 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.4■□□□□ 0.86
FAM220BP-201ENST00000377689 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.4■□□□□ 0.86
FAM220BP-201ENST00000377689 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 OLFM4Q6UX06 510 aa20.39■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.39■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.39■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 UTRNP46939 3433 aa20.39■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 TIAM2Q8IVF5 1701 aa20.39■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.38■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 MPNDQ8N594 471 aa20.38■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.38■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.37■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 FBXO3Q9UK99 471 aa20.37■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 MINPP1Q9UNW1 487 aa20.37■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 XDHP47989 1333 aa20.36■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.36■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 VPS33BQ9H267 617 aa20.36■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 SRGAP3O43295 1099 aa20.35■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 LMNB1P20700 586 aa20.35■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 ATP8B2P98198 1209 aa20.35■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 SLC51AQ86UW1 340 aa20.35■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.35■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 COPRSQ9NQ92 184 aa20.35■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 GPSM2P81274 684 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 RASSF7Q02833 373 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 SSH3Q8TE77 659 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 AAMPQ13685 434 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 POLA2Q14181 598 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 CEP85Q6P2H3 762 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM220BP-201ENST00000377689 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 EYA2O00167 538 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 CIAO1O76071 339 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 ATP2B4P23634 1241 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 PRELPP51888 382 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 CHRNDQ07001 517 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 PSME4Q14997 1843 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 GGA1Q9UJY5 639 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 CRBNQ96SW2 442 aa20.3■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 EYA3Q99504 573 aa20.3■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 POLLQ9UGP5 575 aa20.3■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 UFL1O94874 794 aa20.29■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.29■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 LRRC24Q50LG9 513 aa20.29■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.29■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 RNF181Q9P0P0 153 aa20.29■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.29■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 C6orf229H3BNL8 230 aa20.28■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 HMMRO75330 724 aa20.28■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.28■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 MED23Q9ULK4 1368 aa20.28■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 COL4A5P29400 1685 aa20.28■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.27■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 WASHC4Q2M389 1173 aa20.27■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.27■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
FAM220BP-201ENST00000377689 PPIP5K2O43314 1243 aa20.26■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 PDE8BO95263 885 aa20.26■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 UBE4AQ14139 1066 aa20.26■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 METTL24Q5JXM2 366 aa20.26■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.26■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 SIL1Q9H173 461 aa20.26■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 AOC3Q16853 763 aa20.25■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.25■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 JDP2Q8WYK2 163 aa20.25■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.25■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 SCN9AQ15858 1988 aa20.25■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 TAF5LO75529 589 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 KCNJ4P48050 445 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.24■□□□□ 0.83
FAM220BP-201ENST00000377689 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94 ms