RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 OLFM4Q6UX06 510 aa29.22■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 C7orf43Q8WVR3 580 aa29.22■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 DCTPP1Q9H773 170 aa29.22■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 CNNM1Q9NRU3 951 aa29.22■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 FBXO3Q9UK99 471 aa29.21■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa29.21■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 TMC4Q7Z404 712 aa29.2■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 MINPP1Q9UNW1 487 aa29.2■■■□□ 2.27
PDSS1-201ENST00000376215 LTBP1Q14766 1721 aa29.2■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP29.19■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 SP8Q8IXZ3 490 aa29.19■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.19■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 CHRNDQ07001 517 aa29.18■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 C21orf2O43822 256 aa29.17■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 SASH1O94885 1247 aa29.17■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 IL15P40933 162 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 SNED1Q8TER0 1413 aa29.16■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 MROH5Q6ZUA9 1318 aa29.16■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.16■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 VGLL2Q8N8G2 317 aa29.16■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC136Q96JN2 1154 aa29.16■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 BCS1LQ9Y276 419 aa29.16■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 APBB1O00213 710 aa29.15■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 METTL24Q5JXM2 366 aa29.15■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 UTRNP46939 3433 aa29.14■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 GPSM2P81274 684 aa29.14■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa29.14■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 SMC5Q8IY18 1101 aa29.14■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.14■■■□□ 2.26
PDSS1-201ENST00000376215 DUOX1Q9NRD9 1551 aa29.14■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 TAF5LO75529 589 aa29.13■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 TFCP2Q12800 502 aa29.13■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 GCC1Q96CN9 775 aa29.13■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 KDM2BQ8NHM5 1336 aa29.13■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa29.13■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 RAB11FIP3O75154 756 aa29.12■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 RHPN1Q8TCX5 695 aa29.12■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 PDE8BO95263 885 aa29.11■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 ERC1Q8IUD2 1116 aa29.11■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 ANKRD2Q9GZV1 360 aa29.11■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa29.11■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 CEP126Q9P2H0 1117 aa29.11■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 XDHP47989 1333 aa29.11■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 SNAP23O00161 211 aa29.1■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 PODXL2Q9NZ53 605 aa29.1■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa29.09■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 KIF1BPQ96EK5 621 aa29.09■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC93Q567U6 631 aa29.09■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP29.08■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 MPNDQ8N594 471 aa29.08■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 LRRCC1Q9C099 1032 aa29.08■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa29.08■■■□□ 2.25
PDSS1-201ENST00000376215 POLLQ9UGP5 575 aa29.07■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 ARAP2Q8WZ64 1704 aa29.07■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 SOGA3Q5TF21 947 aa29.06■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF609O15014 1411 aa29.06■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 FGFR2P21802 821 aa29.05■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 TBC1D16Q8TBP0 767 aa29.05■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 ANKRD45Q5TZF3 282 aa29.05■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 RTKN2Q8IZC4 609 aa29.05■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 GGA1Q9UJY5 639 aa29.05■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF804BA4D1E1 1349 aa29.05■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 UFL1O94874 794 aa29.04■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 TNNI3KQ59H18 835 aa29.04■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 LEMD3Q9Y2U8 911 aa29.04■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa29.04■■■□□ 2.24
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PDSS1-201ENST00000376215 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 GPR108Q9NPR9 543 aa29.03■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 KLRK1P26718 216 aa29.02■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 TIMM10P62072 90 aa29.02■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 NUCB1Q02818 461 aa29.02■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 BCL11AQ9H165 835 aa29.02■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 A0A1B0GUL7 405 aa29.02■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 KCNJ4P48050 445 aa29.02■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 AKAP2Q9Y2D5 859 aa29.02■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 IRS2Q9Y4H2 1338 aa29.01■■■□□ 2.24
PDSS1-201ENST00000376215 C6orf229H3BNL8 230 aa29.01■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 NFKBIEO00221 500 aa29.01■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 LPIN2Q92539 896 aa29.01■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 PSMD1Q99460 953 aa29.01■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 TXNRD3Q86VQ6 643 aa29■■■□□ 2.23
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