RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373436.5

RALGPS1-204, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 1,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-204ENST00000373436 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.69■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 C8orf34Q49A92 452 aa24.68■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.68■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 SYT17Q9BSW7 474 aa24.67■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 BBOX1O75936 387 aa24.66■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 LRRC24Q50LG9 513 aa24.66■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 EYA2O00167 538 aa24.66■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 TTLL6Q8N841 843 aa24.66■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 BCL11AQ9H165 835 aa24.66■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.66■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 PIM2Q9P1W9 311 aa24.66■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 FBXO3Q9UK99 471 aa24.65■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 CIAO1O76071 339 aa24.64■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 ATG9AQ7Z3C6 839 aa24.64■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.64■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 SLC51AQ86UW1 340 aa24.63■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.63■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.63■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 A0A1B0GUL6 1792 aa24.63■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 TMC4Q7Z404 712 aa24.62■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.62■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.62■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.61■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.61■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 SP8Q8IXZ3 490 aa24.6■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.6■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 CHRNDQ07001 517 aa24.59■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.59■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.59■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 UTRNP46939 3433 aa24.59■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 RAB11FIP3O75154 756 aa24.59■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 SASH1O94885 1247 aa24.59■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 METTL24Q5JXM2 366 aa24.59■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 OLFM4Q6UX06 510 aa24.59■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.58■■□□□ 1.53
RALGPS1-204ENST00000373436 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.57■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 C21orf2O43822 256 aa24.57■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 BCS1LQ9Y276 419 aa24.57■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 TFCP2Q12800 502 aa24.56■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.56■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.56■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.56■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 LTBP1Q14766 1721 aa24.56■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 TAF5LO75529 589 aa24.56■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.56■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.55■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.55■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 PDE8BO95263 885 aa24.54■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 GPSM2P81274 684 aa24.54■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 BMP2KLQ5H9B9 411 aa24.54■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 XDHP47989 1333 aa24.53■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.53■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.53■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.53■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 SNED1Q8TER0 1413 aa24.53■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 SNAP23O00161 211 aa24.52■■□□□ 1.52
RALGPS1-204ENST00000373436 CCDC93Q567U6 631 aa24.51■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 SOGA3Q5TF21 947 aa24.51■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 MPNDQ8N594 471 aa24.51■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.51■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 TTC22Q5TAA0 569 aa24.5■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.5■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 GGA1Q9UJY5 639 aa24.5■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.5■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.49■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF609O15014 1411 aa24.49■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 KCNJ4P48050 445 aa24.49■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 PDE1AP54750 535 aa24.49■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.49■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 TNNI3KQ59H18 835 aa24.49■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.49■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 GPR108Q9NPR9 543 aa24.49■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 POLLQ9UGP5 575 aa24.49■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.49■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.49■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 UFL1O94874 794 aa24.48■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 SEC24BO95487 1268 aa24.48■■□□□ 1.51
RALGPS1-204ENST00000373436 FGFR2P21802 821 aa24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 131.3 ms