RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 SYT17Q9BSW7 474 aa34.39■■■■□ 3.1
GIPC1-201ENST00000345425 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
GIPC1-201ENST00000345425 ERC1Q8IUD2 1116 aa34.39■■■■□ 3.1
GIPC1-201ENST00000345425 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa34.39■■■■□ 3.1
GIPC1-201ENST00000345425 RAB11FIP3O75154 756 aa34.38■■■■□ 3.09
GIPC1-201ENST00000345425 ATG9AQ7Z3C6 839 aa34.38■■■■□ 3.09
GIPC1-201ENST00000345425 MROH5Q6ZUA9 1318 aa34.37■■■■□ 3.09
GIPC1-201ENST00000345425 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP34.37■■■■□ 3.09
GIPC1-201ENST00000345425 SLX4Q8IY92 1834 aa34.37■■■■□ 3.09
GIPC1-201ENST00000345425 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa34.36■■■■□ 3.09
GIPC1-201ENST00000345425 SP8Q8IXZ3 490 aa34.36■■■■□ 3.09
GIPC1-201ENST00000345425 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa34.36■■■■□ 3.09
GIPC1-201ENST00000345425 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
GIPC1-201ENST00000345425 SMC5Q8IY18 1101 aa34.35■■■■□ 3.09
GIPC1-201ENST00000345425 MINPP1Q9UNW1 487 aa34.35■■■■□ 3.09
GIPC1-201ENST00000345425 METTL24Q5JXM2 366 aa34.34■■■■□ 3.09
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC37AA6NMS7 1700 aa34.33■■■■□ 3.09
GIPC1-201ENST00000345425 CHRNDQ07001 517 aa34.33■■■■□ 3.09
GIPC1-201ENST00000345425 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
GIPC1-201ENST00000345425 KIF1BPQ96EK5 621 aa34.33■■■■□ 3.09
GIPC1-201ENST00000345425 CEP126Q9P2H0 1117 aa34.33■■■■□ 3.09
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD2Q9GZV1 360 aa34.32■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 APBB1O00213 710 aa34.31■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 KDM2BQ8NHM5 1336 aa34.31■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 SASH1O94885 1247 aa34.31■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa34.31■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 RHPN1Q8TCX5 695 aa34.31■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 LRRCC1Q9C099 1032 aa34.31■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 TFCP2Q12800 502 aa34.28■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 C7orf43Q8WVR3 580 aa34.28■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1B0GUL6 1792 aa34.28■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 SOGA3Q5TF21 947 aa34.28■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa34.28■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 BCS1LQ9Y276 419 aa34.28■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 PDE8BO95263 885 aa34.27■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 VGLL2Q8N8G2 317 aa34.27■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 WWC3Q9ULE0 1092 aa34.27■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 XDHP47989 1333 aa34.27■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 C21orf2O43822 256 aa34.26■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 GRIPAP1Q4V328 841 aa34.26■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
GIPC1-201ENST00000345425 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 AKAP2Q9Y2D5 859 aa34.26■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD45Q5TZF3 282 aa34.25■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 PODXL2Q9NZ53 605 aa34.25■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 TAF5LO75529 589 aa34.24■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC93Q567U6 631 aa34.24■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 GPR108Q9NPR9 543 aa34.24■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa34.24■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 GPSM2P81274 684 aa34.23■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 OLFM4Q6UX06 510 aa34.23■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 SLC51AQ86UW1 340 aa34.23■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 MPNDQ8N594 471 aa34.23■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa34.23■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa34.22■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 LEMD3Q9Y2U8 911 aa34.22■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 KCNJ4P48050 445 aa34.21■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 RTKN2Q8IZC4 609 aa34.21■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 ATP2B4P23634 1241 aa34.21■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 NUCB1Q02818 461 aa34.21■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 UBE4AQ14139 1066 aa34.21■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 GGA1Q9UJY5 639 aa34.21■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 LTBP1Q14766 1721 aa34.2■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 ATP2B3Q16720 1220 aa34.2■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 TNNI3KQ59H18 835 aa34.2■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa34.2■■■■□ 3.07
GIPC1-201ENST00000345425 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF609O15014 1411 aa34.19■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 LPIN2Q92539 896 aa34.18■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF804BA4D1E1 1349 aa34.18■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 SNED1Q8TER0 1413 aa34.18■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 UFL1O94874 794 aa34.18■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 CHD1LQ86WJ1 897 aa34.18■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 SLC5A1P13866 664 aa34.17■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 FGFR2P21802 821 aa34.17■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1B0GUL7 405 aa34.16■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
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GIPC1-201ENST00000345425 BCL11AQ9H165 835 aa34.16■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 AACSQ86V21 672 aa34.16■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 LNPKQ9C0E8 428 aa34.16■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 C6orf229H3BNL8 230 aa34.15■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 SUPT20HQ8NEM7 779 aa34.15■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 TIMM10P62072 90 aa34.14■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 NEUROD6Q96NK8 337 aa34.14■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 POLLQ9UGP5 575 aa34.14■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 DUOX1Q9NRD9 1551 aa34.14■■■■□ 3.06
GIPC1-201ENST00000345425 SNAP23O00161 211 aa34.13■■■■□ 3.05
GIPC1-201ENST00000345425 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
GIPC1-201ENST00000345425 PSMD1Q99460 953 aa34.13■■■■□ 3.05
GIPC1-201ENST00000345425 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
GIPC1-201ENST00000345425 EYA3Q99504 573 aa34.12■■■■□ 3.05
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