RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ALDH1B1P30837 517 aa25.06■■□□□ 1.6
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CNKSR1Q969H4 720 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PIM2Q9P1W9 311 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EYA2O00167 538 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TTLL6Q8N841 843 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BBOX1O75936 387 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLX4Q8IY92 1834 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BMP2KLQ5H9B9 411 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRP5O75197 1615 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPEF2Q9C093 1822 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BCL11AQ9H165 835 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CACNA1SQ13698 1873 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C21orf2O43822 256 aa25■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ERC1Q8IUD2 1116 aa25■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BCS1LQ9Y276 419 aa25■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CIAO1O76071 339 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SASH1O94885 1247 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHRNDQ07001 517 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNAP23O00161 211 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TAF5LO75529 589 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 METTL24Q5JXM2 366 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TFCP2Q12800 502 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SP8Q8IXZ3 490 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPSM2P81274 684 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FBXO3Q9UK99 471 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TTC22Q5TAA0 569 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMC4Q7Z404 712 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UTRNP46939 3433 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDE1AP54750 535 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AK9Q5TCS8 1911 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MX1P20591 662 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STAP2Q9UGK3 403 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AOX1Q06278 1338 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDE8BO95263 885 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MPNDQ8N594 471 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 XDHP47989 1333 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.582e-8■■■□□ 17.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC93Q567U6 631 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POLLQ9UGP5 575 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UFL1O94874 794 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TIMM10P62072 90 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNED1Q8TER0 1413 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KLRK1P26718 216 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCNJ4P48050 445 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNNI3KQ59H18 835 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GGA1Q9UJY5 639 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C6orf229H3BNL8 230 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATP2B3Q16720 1220 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.87■■□□□ 1.57
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