RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 SLC51AQ86UW1 340 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 HMMRO75330 724 aa24.2■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 RASSF7Q02833 373 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 CHD4Q14839 1912 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 NFKBIEO00221 500 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
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HOXD11-201ENST00000249504 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 MPNDQ8N594 471 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 SNED1Q8TER0 1413 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 SBF1O95248 1867 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 IGHDP01880 384 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 COPRSQ9NQ92 184 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.16■■□□□ 1.46
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HOXD11-201ENST00000249504 PSMD1Q99460 953 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 UTRNP46939 3433 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 GPSM2P81274 684 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD11-201ENST00000249504 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.14■■□□□ 1.45
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HOXD11-201ENST00000249504 A0A1B0GUL6 1792 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 DCTPP1Q9H773 170 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 LTBP1Q14766 1721 aa24.13■■□□□ 1.45
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HOXD11-201ENST00000249504 CHRNDQ07001 517 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 GGA1Q9UJY5 639 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 C6orf229H3BNL8 230 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 SIL1Q9H173 461 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 RNF181Q9P0P0 153 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
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HOXD11-201ENST00000249504 LRRC24Q50LG9 513 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 FBXO3Q9UK99 471 aa24.1■■□□□ 1.45
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HOXD11-201ENST00000249504 EYA2O00167 538 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 ATP2B4P23634 1241 aa24.1■■□□□ 1.45
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HOXD11-201ENST00000249504 GCC1Q96CN9 775 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 KCNJ4P48050 445 aa24.09■■□□□ 1.45
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HOXD11-201ENST00000249504 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 EYA3Q99504 573 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 POLLQ9UGP5 575 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 PPIP5K2O43314 1243 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 CIAO1O76071 339 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 PRELPP51888 382 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 METTL24Q5JXM2 366 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD11-201ENST00000249504 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
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HOXD11-201ENST00000249504 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 VPS33BQ9H267 617 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 TAF5LO75529 589 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 AOC3Q16853 763 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 WASHC4Q2M389 1173 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 ATG9AQ7Z3C6 839 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 RAB11FIP3O75154 756 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 RIMBP2O15034 1052 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 JDP2Q8WYK2 163 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 SASH1O94885 1247 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 NIM1KQ8IY84 436 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXD11-201ENST00000249504 MED23Q9ULK4 1368 aa24.02■■□□□ 1.44
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