RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 CLCN1P35523 988 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 TTLL11Q8NHH1 800 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 C7orf43Q8WVR3 580 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 KAZALD1Q96I82 304 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 CTSWP56202 376 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 DCAF8L1A6NGE4 600 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ALDH1B1P30837 517 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 SUCLG2Q96I99 432 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 CRAMP1Q96RY5 1269 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 LNPKQ9C0E8 428 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 MYH3P11055 1940 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 CCT4P50991 539 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXO4P98177 505 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB3GAP1Q15042 981 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 GREM2Q9H772 168 aa32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 GRIN3BO60391 1043 aa32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 GRPEL1Q9HAV7 217 aa32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-201ENST00000246533 UTYO14607 1347 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-201ENST00000246533 PLA2G12BQ9BX93 195 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-201ENST00000246533 MEIS3Q99687 375 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-201ENST00000246533 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-201ENST00000246533 RASSF7Q02833 373 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-201ENST00000246533 GRAPQ13588 217 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC152Q4G0S7 254 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-201ENST00000246533 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-201ENST00000246533 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-201ENST00000246533 CSF1RP07333 972 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-201ENST00000246533 PRELPP51888 382 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-201ENST00000246533 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-201ENST00000246533 NFKBIEO00221 500 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-201ENST00000246533 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
CAPNS1-201ENST00000246533 LMBR1LQ6UX01 489 aa32.02■■■□□ 2.72
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD45Q5TZF3 282 aa32.02■■■□□ 2.72
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC17AQ6ZS10 378 aa32.02■■■□□ 2.72
CAPNS1-201ENST00000246533 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
CAPNS1-201ENST00000246533 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa32■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF2CQ99661 725 aa32■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 CHMP3Q9Y3E7 222 aa32■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS8P62241 208 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 BBOX1O75936 387 aa31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 ITGA6P23229 1130 aa31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD44Q8N8A2 993 aa31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 SNED1Q8TER0 1413 aa31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC45O75419 566 aa31.97■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 PANK2Q9BZ23 570 aa31.97■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA6L22H0YM25 854 aa31.96■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa31.96■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 SPEF2Q9C093 1822 aa31.95■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC93Q567U6 631 aa31.95■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.71
CAPNS1-201ENST00000246533 SBF1O95248 1867 aa31.95■■■□□ 2.7
CAPNS1-201ENST00000246533 CHD4Q14839 1912 aa31.95■■■□□ 2.7
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa31.94■■■□□ 2.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SP8Q8IXZ3 490 aa31.94■■■□□ 2.7
CAPNS1-201ENST00000246533 RTL9Q8NET4 1388 aa31.93■■■□□ 2.7
CAPNS1-201ENST00000246533 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa31.92■■■□□ 2.7
CAPNS1-201ENST00000246533 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHDC4Q8TBB5 520 aa31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TAOK3Q9H2K8 898 aa31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-201ENST00000246533 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-201ENST00000246533 RABEP1Q15276 862 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SOGA3Q5TF21 947 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-201ENST00000246533 C9orf131Q5VYM1 1079 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf115Q9H7X2 142 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 GPSM2P81274 684 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 RTKN2Q8IZC4 609 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC37AA6NMS7 1700 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 ESPNB1AK53 854 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC57Q2TAC2 916 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF181Q9P0P0 153 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 SIRT2Q8IXJ6 389 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 GNAI3P08754 354 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 MPNDQ8N594 471 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 MINPP1Q9UNW1 487 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 DCTPP1Q9H773 170 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-201ENST00000246533 DUOX1Q9NRD9 1551 aa31.84■■■□□ 2.69
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