RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616122.4

SYNCRIP-204, Transcript of synaptotagmin binding cytoplasmic RNA interacting protein, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYNCRIP, Length 6,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIP-204ENST00000616122 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 ZNF85Q03923 595 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 ZNF141Q15928 474 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 ISXQ2M1V0 245 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 PRAMEF20Q5VT98 475 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 FAAP20Q6NZ36 180 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 FAM198BQ6UWH4 519 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 STAC2Q6ZMT1 411 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 IDO2Q6ZQW0 420 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 Q6ZTK2 550 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 ZNF454Q8N9F8 522 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 NPRL2Q8WTW4 380 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 RADILQ96JH8 1075 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 MCCC2Q9HCC0 563 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 A0A1W2PPL8 197 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 OR2AT4A6NND4 320 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 ZNF878C9JN71 531 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 GPR171O14626 319 aa5.12□□□□□ -1.59
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SYNCRIP-204ENST00000616122 TSPAN9O75954 239 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 TP53P04637 393 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 ANK1P16157 1881 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 OR1D5P58170 312 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 NKAIN2Q5VXU1 208 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 STEAP1BQ6NZ63 245 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 C5orf46Q6UWT4 87 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 CD163Q86VB7 1156 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 OR10AC1Q8NH08 325 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 KCNJ15Q99712 375 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 PLEK2Q9NYT0 353 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 UBQLN2Q9UHD9 624 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 FLVCR2Q9UPI3 526 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 B9D1Q9UPM9 204 aa5.12□□□□□ -1.59
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SYNCRIP-204ENST00000616122 A0A0G2JMZ2 1700 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 SCN4AP35499 1836 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 A6NCN8 305 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 DISC1C4P0D8 188 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 F5H5K5 113 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 DOK2O60496 412 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 GMDSO60547 372 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 ADAM11O75078 769 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 SCRG1O75711 98 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 PIAS2O75928 621 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 THY1P04216 161 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 RAG2P55895 527 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 OPCMLQ14982 345 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 ARL6IP1Q15041 203 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 CDONQ4KMG0 1287 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 ELP2Q6IA86 826 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 SYT13Q7L8C5 426 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 PGAM5Q96HS1 289 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 OR8B4Q96RC9 309 aa5.12□□□□□ -1.59
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SYNCRIP-204ENST00000616122 CLEC1BQ9P126 229 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 COPS3Q9UNS2 423 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 WDR81Q562E7 1941 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 ALG1L2C9J202 215 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 DCTN6O00399 190 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 SEC14L5O43304 696 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 AKR7A3O95154 331 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 PLATP00750 562 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 HPXP02790 462 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 PDGFAP04085 211 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 ADRA2AP08913 450 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 SMIM10L1P0DMW3 83 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 GLULP15104 373 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 CTLA4P16410 223 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 AGTR1P30556 359 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 ACSM1Q08AH1 577 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 RAET1LQ5VY80 246 aa5.12□□□□□ -1.59
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SYNCRIP-204ENST00000616122 UEVLDQ8IX04 471 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 FAM109AQ8N4B1 249 aa5.12□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 SPEM1Q8N4L4 309 aa5.12□□□□□ -1.59
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SYNCRIP-204ENST00000616122 OR5B2Q96R09 309 aa5.12□□□□□ -1.59
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SYNCRIP-204ENST00000616122 ASH2LQ9UBL3 628 aa5.12□□□□□ -1.59
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SYNCRIP-204ENST00000616122 SUSD5O60279 629 aa5.11□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 RBMXP38159 391 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 CAMK2DQ13557 499 aa5.11□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 COL28A1Q2UY09 1125 aa5.11□□□□□ -1.59
SYNCRIP-204ENST00000616122 CARD17Q5XLA6 110 aa5.11□□□□□ -1.59
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