RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 GAB2Q9UQC2 676 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF264O43296 627 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TFAP2AP05549 437 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 COX6CP09669 75 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SDC1P18827 310 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 LYSMD4Q5XG99 296 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 BCORQ6W2J9 1755 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OSGIN2Q9Y236 505 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 INSL5Q9Y5Q6 135 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TYRP1P17643 537 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 NME2P22392 152 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 FCRLBQ6BAA4 426 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 NAT6Q93015 286 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 FBXL2Q9UKC9 423 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 FER1L5A0AVI2 2057 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ZFP92A6NM28 416 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ZP3P21754 424 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 GATMP50440 423 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CORO6Q6QEF8 472 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OR1L1Q8NH94 360 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 HELTA6NFD8 242 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 COCHO43405 550 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 STC2O76061 302 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OR2AE1Q8NHA4 323 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ISL2Q96A47 359 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TVP23CQ96ET8 276 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 UBQLN3Q9H347 655 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 BCO1Q9HAY6 547 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CA14Q9ULX7 337 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SLC5A10A0PJK1 596 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF860A6NHJ4 632 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SIX6O95475 246 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 C5AR1P21730 350 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 RAB33AQ14088 237 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 KIR2DS3Q14952 304 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OR10C1Q96KK4 312 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ANK1P16157 1881 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 LRP6O75581 1613 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 K7ERQ8 282 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 RRASP10301 218 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SYN1P17600 705 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 GM2AP17900 193 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SIRPAP78324 504 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 GAB1Q13480 694 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 IP6K3Q96PC2 410 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 NSG2Q9Y328 171 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SCN5AQ14524 2016 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 FAM72CH0Y354 149 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 DEGS1O15121 323 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CPEP16870 476 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CCR9P51686 369 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 FAM72AQ5TYM5 149 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 FAM72DQ6L9T8 149 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CGB2Q6NT52 195 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 Q6ZVL8 140 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 FAM72BQ86X60 149 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OR1J1Q8NGS3 322 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TREX1Q9NSU2 369 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 GPR34Q9UPC5 381 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 FAM183AA6NL82 134 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 A8MU76 341 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 GPR171O14626 319 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ATP1B1P05026 303 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CD79AP11912 226 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SLC35A1P78382 337 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 VWA1Q6PCB0 445 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 NPWQ8N729 165 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms