RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 HLA-DQA2P01906 255 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 SERPINB10P48595 397 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 CDK5R1Q15078 307 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC18B1Q6NT16 456 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 IGFL3Q6UXB1 125 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM123Q8N131 208 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 TBC1D15Q8TC07 691 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM203Q969S6 136 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 OR2M2Q96R28 347 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 TM9SF2Q99805 663 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 GNG8Q9UK08 70 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 RCE1Q9Y256 329 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 A3GALT2U3KPV4 340 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 SPINK2P20155 84 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 ROM1Q03395 351 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNMB1Q16558 191 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 UBQLNLQ8IYU4 475 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 MEIOBQ8N635 442 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 MCHR2Q969V1 340 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 PGLYRP3Q96LB9 341 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 MED18Q9BUE0 208 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNG2Q9UJ96 466 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 CSAG2Q9Y5P2 127 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRTM2O43300 516 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 UPK3AO75631 287 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT8P05787 483 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF823P16415 610 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 LAP3P28838 519 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAM8P78325 824 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 RNFT1Q5M7Z0 435 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 C10orf128Q5T292 105 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 ARL9Q6T311 187 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 MS4A15Q8N5U1 240 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 NEIL3Q8TAT5 605 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 PNPLA2Q96AD5 504 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 SMIM19Q96E16 107 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 KCTD7Q96MP8 289 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 OR8B4Q96RC9 309 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 TTYH2Q9BSA4 534 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 TTTY10Q9BZA0 68 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 ACOXLQ9NUZ1 547 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 GLTPQ9NZD2 209 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 DKK4Q9UBT3 224 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 GABRPO00591 440 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 MPZL1O95297 269 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 CSNK1A1P48729 337 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 FDX2Q6P4F2 183 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 LRFN4Q6PJG9 635 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM91Q6ZNR0 172 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM220AQ7Z4H9 259 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 THEM6Q8WUY1 208 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXN4Q96NZ1 517 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 TMED9Q9BVK6 235 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 GPRIN2O60269 458 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 SC5DO75845 299 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 IL1AP01583 271 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHG3P01860 377 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 QDPRP09417 244 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 SPARCP09486 303 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 OR8G3PP0DMU2 310 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 LIPNQ5VXI9 398 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 CARD17Q5XLA6 110 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 C22orf42Q6IC83 251 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 RPTNQ6XPR3 784 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 FCRLAQ7L513 359 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 C20orf196Q8IYI0 205 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 C11orf40Q8WZ69 217 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 ROBO4Q8WZ75 1007 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 NSMAFQ92636 917 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM45BQ96B21 275 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 AMELYQ99218 206 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-207ENST00000589146 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 CPN1P15169 458 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 EDNRAP25101 427 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC3A1Q07837 685 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 MOGQ16653 247 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 MEP1BQ16820 701 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF679Q8IYX0 411 aa20.2■□□□□ 0.82
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