RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 SLC35A2P78381 396 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 DDOQ99489 341 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 FAM234AQ9H0X4 552 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 HIF1ANQ9NWT6 349 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 GNG12Q9UBI6 72 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 B4GALT3O60512 393 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 Q96M85 177 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 LHX6Q9UPM6 363 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
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PTPRM-211ENST00000580170 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 MUCL1Q96DR8 90 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 IFT22Q9H7X7 185 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 SCO1O75880 301 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 IHHQ14623 411 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 FJX1Q86VR8 437 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM99Q8N816 258 aa19.6■□□□□ 0.73
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PTPRM-211ENST00000580170 SLCO4A1Q96BD0 722 aa19.6■□□□□ 0.73
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PTPRM-211ENST00000580170 TO15178 435 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 CPEP16870 476 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 MAP2K6P52564 334 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 NAXDQ8IW45 347 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
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PTPRM-211ENST00000580170 ECI1P42126 302 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 PHLDA2Q53GA4 152 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 MANEAQ5SRI9 462 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 WDR88Q6ZMY6 472 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 OR1S2Q8NGQ3 325 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 ABHD16AO95870 558 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 AADACP22760 399 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 EPHA5P54756 1037 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 METRNLQ641Q3 311 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 MS4A6EQ96DS6 147 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 SPHK1Q9NYA1 384 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
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PTPRM-211ENST00000580170 HLA-DOBP13765 273 aa19.58■□□□□ 0.73
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PTPRM-211ENST00000580170 OR11L1Q8NGX0 322 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 SUCNR1Q9BXA5 334 aa19.58■□□□□ 0.73
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PTPRM-211ENST00000580170 RAF1P04049 648 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 NAT1P18440 290 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 HTRA3P83110 453 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 TLCD2A6NGC4 264 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 CCSO14618 274 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 EIF1P41567 113 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF266Q14584 549 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 OR1J2Q8NGS2 313 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRM-211ENST00000580170 CHST2Q9Y4C5 530 aa19.58■□□□□ 0.73
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PTPRM-211ENST00000580170 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa19.58■□□□□ 0.72
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PTPRM-211ENST00000580170 TMEM235A6NFC5 223 aa19.58■□□□□ 0.72
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC19A1P41440 591 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRM-211ENST00000580170 RPL27P61353 136 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
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PTPRM-211ENST00000580170 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
PTPRM-211ENST00000580170 HLA-HP01893 362 aa19.57■□□□□ 0.72
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PTPRM-211ENST00000580170 GDPD3Q7L5L3 318 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRM-211ENST00000580170 SUMF1Q8NBK3 374 aa19.57■□□□□ 0.72
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PTPRM-211ENST00000580170 PDXPQ96GD0 296 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRM-211ENST00000580170 FGF21Q9NSA1 209 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRM-211ENST00000580170 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRM-211ENST00000580170 GPX5O75715 221 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRM-211ENST00000580170 SLC2A10O95528 541 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRM-211ENST00000580170 MT-ND4LP03901 98 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRM-211ENST00000580170 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF813Q6ZN06 617 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRM-211ENST00000580170 NXPE3Q969Y0 559 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRM-211ENST00000580170 SLC35A4Q96G79 324 aa19.57■□□□□ 0.72
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