RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 OR6N2Q8NGY6 317 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 OR52E5Q8NH55 327 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 ORAI1Q96D31 301 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 WDR34Q96EX3 536 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 PAGE5Q96GU1 130 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM19Q96HH6 336 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF75AQ96N20 296 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 OR8B4Q96RC9 309 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 IL4I1Q96RQ9 567 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 MYADMQ96S97 322 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 ACOX2Q99424 681 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 LPAR4Q99677 370 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 UGT2B28Q9BY64 529 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 MMP28Q9H239 520 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 SYT4Q9H2B2 425 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 FAM96AQ9H5X1 160 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 SLC28A3Q9HAS3 691 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 BEX1Q9HBH7 125 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM27Q9HBJ8 222 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 WFDC1Q9HC57 220 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 Q9N2K0 584 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 PRSS16Q9NQE7 514 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 ECHDC1Q9NTX5 307 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 RASL12Q9NYN1 266 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 MED11Q9P086 117 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA1456Q9P272 454 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 FBXL4Q9UKA2 621 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 FBXO5Q9UKT4 447 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 UFC1Q9Y3C8 167 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 RAP2CQ9Y3L5 183 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 PEX16Q9Y5Y5 336 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 PRSS21Q9Y6M0 314 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 V9GYY9 64 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 FGD6Q6ZV73 1430 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 SSH2Q76I76 1423 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 SNED1Q8TER0 1413 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TCHHQ07283 1943 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 AKAP11Q9UKA4 1901 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM2Q9UHN6 1383 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 ASTN1O14525 1302 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 NEDD4P46934 1319 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 CLTCL1P53675 1640 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 A0A087X0K7 114 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 A0A096LPI6 279 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PRD5 423 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 IGLON5A6NGN9 336 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 HSPB2A8KAH6 182 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D3LB9A6J9 549 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 USP17L23D6RBM5 183 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 H3BSA7 217 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 M0QYT0 321 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 CLDN5O00501 218 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 SLC31A1O15431 190 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 FCN3O75636 299 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 OR2B3O76000 313 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 S1PR2O95136 353 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TNFSF15O95150 251 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 GADD45GO95257 159 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 GPR75O95800 540 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 C1QCP02747 245 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 NR3C1P04150 777 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 ARG1P05089 322 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 BCHEP06276 602 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 CHRM4P08173 479 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 CST2P09228 141 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D3HP0C7X1 549 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 LYL1P12980 280 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 IL7P13232 177 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 FOLR2P14207 255 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 FOLR1P15328 257 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF250P15622 560 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 SLC2A5P22732 501 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 OMGP23515 440 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 AK4P27144 223 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 SRD5A2P31213 254 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 CCKARP32238 428 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 CDAP32320 146 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 GGT2P36268 569 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 HPCAL1P37235 193 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 CRYBB2P43320 205 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 EVX1P49640 407 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TDGF1P3P51864 188 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TMBIM6P55061 237 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 FOXL2P58012 376 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 RAB10P61026 200 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 MAXP61244 160 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms