RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	MED30	Q96HR3	178 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	OR8B4	Q96RC9	309 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	NEK6	Q9HC98	313 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	CKLF	Q9UBR5	152 aa		10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442		A0A1W2PQ72	361 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	GNB5	O14775	395 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	SELENOF	O60613	162 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	SCGN	O76038	276 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ZFPL1	O95159	310 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ABHD16A	O95870	558 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	FBXO45	P0C2W1	286 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	PSKH1	P11801	424 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ICAM2	P13598	275 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF823	P16415	610 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ART1	P52961	327 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	GABRE	P78334	506 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	PUDP	Q08623	228 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC17A1	Q14916	467 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	KCNJ8	Q15842	424 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ACKR1	Q16570	336 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	NTRK2	Q16620	822 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	THEM4	Q5T1C6	240 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	OPN5	Q6U736	354 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	LINGO2	Q7L985	606 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	SSX6	Q7RTT6	188 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	CDH26	Q8IXH8	852 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIM63	Q969Q1	353 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	PTX4	Q96A99	478 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	MAP6	Q96JE9	813 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	RBP7	Q96R05	134 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	OR2M2	Q96R28	347 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	OR6C1	Q96RD1	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ZPBP	Q9BS86	351 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	NOX4	Q9NPH5	578 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	MYOT	Q9UBF9	498 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM72	A0PK05	275 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442		A8MU76	341 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442		C9J4A7	227 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ACOT7	O00154	380 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	SULT1C2	O00338	296 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	OIP5	O43482	229 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	MT-CO3	P00414	261 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	S100A1	P23297	94 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	GRPR	P30550	384 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	CAV3	P56539	151 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	MAB21L1	Q13394	359 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	P2RY14	Q15391	338 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	TATDN3	Q17R31	274 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	PLA1A	Q53H76	456 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	GATS	Q8NAP1	163 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	OR56B4	Q8NH76	319 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	M1AP	Q8TC57	530 aa		10.62	□□□□□ -0.71
LETMD1-223	ENST00000550442	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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