RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 GAMTQ14353 236 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 FGFBP1Q14512 234 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 ELP2Q6IA86 826 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 CFAP161Q6P656 301 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 PARM1Q6UWI2 310 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 KIRREL2Q6UWL6 708 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC5A8Q8N695 610 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 SOCS4Q8WXH5 440 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC35C1Q96A29 364 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 HSH2DQ96JZ2 352 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 SFXN2Q96NB2 322 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 ELOVL1Q9BW60 279 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 BOCQ9BWV1 1114 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 BCO2Q9BYV7 579 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 RAB6CQ9H0N0 254 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 PIF1Q9H611 641 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 BPIFA1Q9NP55 256 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 SMOXQ9NWM0 555 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 DDIT4Q9NX09 232 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 HSPB7Q9UBY9 170 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 CES1P1Q9UKY3 287 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 LHX6Q9UPM6 363 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 DOK2O60496 412 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 CTNSO60931 367 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 OR8G3PP0DMU2 310 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 OR1E1P30953 314 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 ARRB2P32121 409 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 GPR4P46093 362 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 DYNLT3P51808 116 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 WDR5P61964 334 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 OPCMLQ14982 345 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 EML3Q32P44 896 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 C9orf152Q5JTZ5 239 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 MARC1Q5VT66 337 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 LYG2Q86SG7 212 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 PLPP6Q8IY26 295 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 TEX26Q8N6G2 289 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 ZDHHC22Q8N966 263 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 GPR151Q8TDV0 419 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 WDR34Q96EX3 536 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 LYSMD1Q96S90 227 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 TUBE1Q9UJT0 475 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 LAMP3Q9UQV4 416 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 ADGBQ8N7X0 1667 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 ADCY9O60503 1353 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 TRAV20A0A0B4J274 112 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 FCN1O00602 326 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 ARPC3O15145 178 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 MBTPS2O43462 519 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 PAGE4O60829 102 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 F7P08709 466 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 TACR1P25103 407 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 HTR1DP28221 377 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 HTR7P34969 479 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 CRHR1P34998 444 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 PPP1CBP62140 327 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF404Q494X3 552 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 NANOGP8Q6NSW7 305 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 TCF23Q7RTU1 214 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 CAMKMTQ7Z624 323 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 CLEC1AQ8NC01 280 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 OR52B6Q8NGF0 335 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 NETO1Q8TDF5 533 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 C14orf79Q96F83 325 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 OSMRQ99650 979 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 OR10A2Q9H208 303 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC52A3Q9NQ40 469 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 LHX3Q9UBR4 397 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 CBLCQ9ULV8 474 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 ST3GAL6Q9Y274 331 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 SNX11Q9Y5W9 270 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 PXDNLA1KZ92 1463 aa2.92□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 IRS2Q9Y4H2 1338 aa2.91□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
JMJD1C-210ENST00000542921 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms