RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542838.5

DDX11-223, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DDX11, Length 3,079 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-223	ENST00000542838	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	PHYH	O14832	338 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	ST6GAL1	P15907	406 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	MEP1B	Q16820	701 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	TMEM205	Q6UW68	189 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	GALNT16	Q8N428	558 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	SEH1L	Q96EE3	360 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	OR5H14	A6NHG9	310 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	HSPB2	A8KAH6	182 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	PRKACA	P17612	351 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	CFP	P27918	469 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	ARHGDIB	P52566	201 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	HSPB2	Q16082	182 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	OTOS	Q8NHW6	89 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	ZNF563	Q8TA94	476 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	THRSP	Q92748	146 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	MELTF	P08582	738 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	MAOA	P21397	527 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	FGL1	Q08830	312 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	TMEM240	Q5SV17	173 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	MED25	Q71SY5	747 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	ASB12	Q8WXK4	309 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	NPAS1	Q99742	590 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	C11orf98	E9PRG8	122 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	SULT1C2	O00338	296 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	GMFG	O60234	142 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	ALOX12B	O75342	701 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	HOXB2	P14652	356 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	MC2R	Q01718	297 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	SLC17A1	Q14916	467 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	NR0B2	Q15466	257 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	TAF13	Q15543	124 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	BEX5	Q5H9J7	111 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	TMEM17	Q86X19	198 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	EDA	Q92838	391 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	BAD	Q92934	168 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	TAAR8	Q969N4	342 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	MARC2	Q969Z3	335 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	OR8B4	Q96RC9	309 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	COMMD9	Q9P000	198 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	DHDH	Q9UQ10	334 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	CDH23	Q9H251	3354 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	FAM74A7	A6NL05	159 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	CLDN4	O14493	209 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	TNFRSF10C	O14798	259 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	CD8A	P01732	235 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	CD34	P28906	385 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	PBX2	P40425	430 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	TNFRSF4	P43489	277 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	SKP2	Q13309	424 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	FAM166A	Q6J272	317 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	ZNF524	Q96C55	264 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	SCD	O00767	359 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	CCS	O14618	274 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	PNP	P00491	289 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-223	ENST00000542838	RAB3A	P20336	220 aa		11.66	□□□□□ -0.54

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