RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	MCHR2	Q969V1	340 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF347	Q96SE7	839 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ASPN	Q9BXN1	380 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		10.12	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	PLSCR5	A0PG75	271 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	C5orf49	A4QMS7	147 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM178B	H3BS89	294 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	GPR137B	O60478	399 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	TGDS	O95455	350 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	KRT75	O95678	551 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	IGHV4-59	P01825	116 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	BPGM	P07738	259 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	SFTPB	P07988	381 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ADORA3	P0DMS8	318 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	STOM	P27105	288 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	CDA	P32320	146 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	SERPINB5	P36952	375 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	FGF12	P61328	243 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	PSG7	Q13046	419 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	SLC36A2	Q495M3	483 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	FAM201A	Q5SY85	155 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	C10orf111	Q8N326	155 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	FITM2	Q8N6M3	262 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	C10orf82	Q8WW14	230 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	SLC35B4	Q969S0	331 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	C1orf198	Q9H425	327 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	NOX4	Q9NPH5	578 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	CALML5	Q9NZT1	146 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	IFT52	Q9Y366	437 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557		A0A0B4J2E0	115 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1B0GX12	115 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	THY1	P04216	161 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	MYZAP	P0CAP1	466 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF32	P17041	273 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	LBP	P18428	481 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	APLNR	P35414	380 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ETV4	P43268	484 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ERF	P50548	548 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	CDH12	P55289	794 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	PPP1CB	P62140	327 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	PSG4	Q00888	419 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	PLP2	Q04941	152 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	OR1Q1	Q15612	314 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ULK3	Q6PHR2	472 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	KLB	Q86Z14	1044 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM86B	Q8N661	226 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	OR5J2	Q8NH18	312 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	MRAP	Q8TCY5	172 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF566	Q969W8	418 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	NABP1	Q96AH0	204 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	SAMD8	Q96LT4	415 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ZIM3	Q96PE6	472 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	SORT1	Q99523	831 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	NUF2	Q9BZD4	464 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	AIG1	Q9NVV5	245 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	COL7A1	Q02388	2944 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	C5orf63	A6NC05	138 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	C22orf46	C9J442	243 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	RFXANK	O14593	260 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-222	ENST00000533557	ERLIN1	O75477	346 aa		10.09	□□□□□ -0.79

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