RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531967.5

ECHDC1-222, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-222ENST00000531967 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 Q6ZSR9 355 aa4.56□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 LYG2Q86SG7 212 aa4.56□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 IQCF1Q8N6M8 205 aa4.56□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 SLC37A3Q8NCC5 494 aa4.56□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 MDS2Q8NDY4 140 aa4.56□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 OR9Q2Q8NGE9 314 aa4.56□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 OR9A4Q8NGU2 314 aa4.56□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 ACP6Q9NPH0 428 aa4.56□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 IFT46Q9NQC8 304 aa4.56□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 TMEM9Q9P0T7 183 aa4.56□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 PSG11Q9UQ72 335 aa4.56□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 MTCH2Q9Y6C9 303 aa4.56□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 R4GN57 208 aa4.56□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 TNRQ92752 1358 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 AGLP35573 1532 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 TIMM23O14925 209 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 FGF16O43320 207 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 HPGDSO60760 199 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 MPDU1O75352 247 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 ZNF12P17014 697 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 TIMP3P35625 211 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 TALDO1P37837 337 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 LEPP41159 167 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 MAGEA12P43365 314 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 RASSF2P50749 326 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 OR4D2P58180 307 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 NAA20P61599 178 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 RANP62826 216 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 FAM3AP98173 230 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 DGUOKQ16854 277 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 FFAR4Q5NUL3 377 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 ASB18Q6ZVZ8 466 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 C12orf29Q8N999 325 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 PXT1Q8NFP0 134 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 OR52H1Q8NGJ2 320 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 C12orf57Q99622 126 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 ATF6BQ99941 703 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 MFSD1Q9H3U5 465 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 A4GALTQ9NPC4 353 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 NRN1Q9NPD7 142 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 FBXL4Q9UKA2 621 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 PACSIN3Q9UKS6 424 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 ARHGEF10O15013 1369 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 NRKQ7Z2Y5 1582 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 TAF1P21675 1872 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 FAM172BPA6NC97 362 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 C9orf118A6NHY6 69 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 E9PAM4 449 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 IGSF6O95976 241 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 IGLV1-40P01703 118 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 RPS19P39019 145 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 UGT2B15P54855 530 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 RHOAP61586 193 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 HAGHQ16775 308 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 MSMPQ1L6U9 139 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 FAM45BPQ6NSW5 357 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 ABHD12Q8N2K0 398 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 OR2L13Q8N349 312 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 OR6K6Q8NGW6 343 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 OR11L1Q8NGX0 322 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 OR5K2Q8NHB8 316 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 MZB1Q8WU39 189 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 NAT14Q8WUY8 206 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 RAB34Q9BZG1 259 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 SIAEQ9HAT2 523 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 VAPAQ9P0L0 249 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 ARL5AQ9Y689 179 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 SLC22A7Q9Y694 548 aa4.55□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 PXDNLA1KZ92 1463 aa4.54□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 NCANO14594 1321 aa4.54□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa4.54□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 ASPDHA6ND91 283 aa4.54□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 F5H768 121 aa4.54□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 J3QLI3 93 aa4.54□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 TXNDC9O14530 226 aa4.54□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 SIGLEC5O15389 551 aa4.54□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 GLSO94925 669 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 ESRRBO95718 433 aa4.54□□□□□ -1.68
ECHDC1-222ENST00000531967 SLC2A1P11166 492 aa4.54□□□□□ -1.68
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