RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	RELA	Q04206	551 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	MED21	Q13503	144 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	GPR50	Q13585	617 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	RGN	Q15493	299 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ATP6AP1	Q15904	470 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	HKDC1	Q2TB90	917 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM64	Q6YI46	380 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	PHC2	Q8IXK0	858 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	NATD1	Q8N6N6	113 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	OR2L3	Q8NG85	312 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ZFP90	Q8TF47	636 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	PYURF	Q96I23	114 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	PANX1	Q96RD7	426 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF559	Q9BR84	538 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CENPK	Q9BS16	269 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	MS4A8	Q9BY19	250 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	TRIM4	Q9C037	500 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	AICDA	Q9GZX7	198 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	XKR8	Q9H6D3	395 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	JPT2	Q9H910	190 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	LHX9	Q9NQ69	397 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	C8orf4	Q9NR00	106 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	MED17	Q9NVC6	651 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	AURKC	Q9UQB9	309 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	TRANK1	O15050	2925 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPS13-208	ENST00000531908	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		4.09	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	NUMA1	Q14980	2115 aa		4.09	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908		A0A0A6YYD5	115 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	BTN3A3	O00478	584 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	SYT7	O43581	403 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	GMNN	O75496	209 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	COL4A2	P08572	1712 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	SHMT2	P34897	504 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	HPCAL1	P37235	193 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	RABIF	P47224	123 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	HSPA13	P48723	471 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	HBA1	P69905	142 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	CHRNB3	Q05901	458 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	FZD2	Q14332	565 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	PDK3	Q15120	406 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908		Q6ZS52	159 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	TMUB2	Q71RG4	321 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908		Q8N377	158 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	CBR4	Q8N4T8	237 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPS13-208	ENST00000531908	TTL	Q8NG68	377 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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