RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531616.1

ARHGEF12-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF12, Length 3,108 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12-211ENST00000531616 EMC2Q15006 297 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 TMED2Q15363 201 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 ISXQ2M1V0 245 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 CD300LGQ6UXG3 332 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 TMEM251Q8N6I4 163 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 NANOGP1Q8N7R0 232 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 OR8D1Q8WZ84 308 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 CDS1Q92903 461 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 SH2D2AQ9NP31 389 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 ASIC5Q9NY37 505 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 FRG2CA6NGY1 282 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 SAGE2PA6NJ88 616 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 ANHXE9PGG2 379 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 H3BTX0 84 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 ZIC3O60481 467 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 CTNSO60931 367 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 UGT2B17O75795 530 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 LIPCP11150 499 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 M6PRP20645 277 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 PROZP22891 400 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 UGT2B15P54855 530 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 RAB10P61026 200 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 CFHR3Q02985 330 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 TNFRSF9Q07011 255 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 PON3Q15166 354 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 DTX2Q86UW9 622 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 ITIH5Q86UX2 942 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 MRAPQ8TCY5 172 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 BORCS5Q969J3 196 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 POLD4Q9HCU8 107 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 SYBUQ9NX95 663 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 CNMDO75829 334 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 SNAP29O95721 258 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 SLC25A27O95847 323 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 CLDN18P56856 261 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 OR10A3P58181 314 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 FCHO2Q0JRZ9 810 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 OR1C1Q15619 314 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 MARCH9Q86YJ5 346 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 BBS7Q8IWZ6 715 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 KBTBD8Q8NFY9 601 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 ITCHQ96J02 903 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 S1PR3Q99500 378 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 VCX3AQ9NNX9 186 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 PSMB11A5LHX3 300 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 GNB5O14775 395 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 ANXA9O76027 345 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 TYMSP04818 313 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 ACSM4P0C7M7 580 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 ZNF23P17027 643 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 MAOAP21397 527 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 DLX5P56178 289 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 MAZP56270 477 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 MESP2Q0VG99 397 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 KLRB1Q12918 225 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 GGTLC2Q14390 218 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 C1QL3Q5VWW1 255 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 ZNF787Q6DD87 383 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 DHFR2Q86XF0 187 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 CALHM1Q8IU99 346 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 SLC37A3Q8NCC5 494 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 OR52H1Q8NGJ2 320 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 TLCD1Q96CP7 247 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 CSF3RQ99062 836 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 KXD1Q9BQD3 176 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 R4GN57 208 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 CXCR6O00574 342 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 LSM8O95777 96 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 GABRG2P18507 467 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 SFTPDP35247 375 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 SLC47A2Q86VL8 602 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 OR6V1Q8N148 313 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 PRELID2Q8N945 189 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 PIGXQ8TBF5 258 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF12-211ENST00000531616 ART4Q93070 314 aa7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms