RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522995.1

CEP170-223, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 3

Gene CEP170, Length 608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-223	ENST00000522995	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	OR52D1	Q9H346	318 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	RNF121	Q9H920	327 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	IMPA2	O14732	288 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	SMPD2	O60906	423 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	UBL3	O95164	117 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	DANCR	P0C864	163 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	NR2C1	P13056	603 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	FOSL1	P15407	271 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	CALCR	P30988	508 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	SDHA	P31040	664 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	SLC6A6	P31641	620 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	FABP6	P51161	128 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	RPS6KA3	P51812	740 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	ETFDH	Q16134	617 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	FNDC8	Q8TC99	324 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	ZNF75A	Q96N20	296 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	IFT27	Q9BW83	186 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	RERGL	Q9H628	205 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	SIAE	Q9HAT2	523 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CEP170-223	ENST00000522995	PRSS37	A4D1T9	235 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	FKBP6	O75344	327 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	ENTPD5	O75356	428 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	RAB36	O95755	333 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	CD8A	P01732	235 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	RAB39A	Q14964	217 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995		A0A1W2PPL8	197 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	AHCYL1	O43865	530 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	TXNDC12	O95881	172 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	NPR2	P20594	1047 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	TTK	P33981	857 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	HGFAC	Q04756	655 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	SLC36A2	Q495M3	483 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	NRN1L	Q496H8	165 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995		Q5PR19	223 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	SHE	Q5VZ18	495 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	VHLL	Q6RSH7	139 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	ASRGL1	Q7L266	308 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	GIPC3	Q8TF64	312 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	NABP1	Q96AH0	204 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	PERP	Q96FX8	193 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	C18orf12	Q96KH6	178 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	SYT4	Q9H2B2	425 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	YY1AP1	Q9H869	796 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	EBAG9	O00559	213 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	SLC16A7	O60669	478 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	TIPRL	O75663	272 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	SERPINA5	P05154	406 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	SCG5	P05408	212 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	CTLA4	P16410	223 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	LAP3	P28838	519 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	NOS3	P29474	1203 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	FAM27B	Q5VT28	67 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	AGAP6	Q5VW22	663 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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