RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512673.1

ALYREF-204, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 2

Gene ALYREF, Length 441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-204ENST00000512673 OR4S1Q8NGB4 309 aa12.86□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 TWIST2Q8WVJ9 160 aa12.86□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 IFT81Q8WYA0 676 aa12.86□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 B9D2Q9BPU9 175 aa12.86□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 OCSTAMPQ9BR26 566 aa12.86□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 TMEM246Q9BRR3 403 aa12.86□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 TRIM15Q9C019 465 aa12.86□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 LRMDAQ9H2I8 198 aa12.86□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 PPA2Q9H2U2 334 aa12.86□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 CYSLTR2Q9NS75 346 aa12.86□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 HYDINQ4G0P3 5121 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 ANKRD61A6NGH8 418 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 IGHV1-69P01742 117 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 DBIP07108 87 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 ARRB2P32121 409 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 MMP16P51512 607 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 XKR7Q5GH72 579 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 PGBD2Q6P3X8 592 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 LYPD2Q6UXB3 125 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 NHLRC1Q6VVB1 395 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 SLC16A14Q7RTX9 510 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 LRRC18Q8N456 261 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 OR8B3Q8NGG8 313 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 ABHD4Q8TB40 342 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 AGR3Q8TD06 166 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 PLEKHA8Q96JA3 519 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 SAMD8Q96LT4 415 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 OR8B2Q96RD0 313 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 FMO2Q99518 471 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 TXLNGYQ9BZA5 131 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 DPAGT1Q9H3H5 408 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 C1orf198Q9H425 327 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 KIF17Q9P2E2 1029 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 FBLN5Q9UBX5 448 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 MIOXQ9UGB7 285 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 VPREB3Q9UKI3 123 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 USH1CQ9Y6N9 552 aa12.85□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 A0A087WUJ7 227 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 P2RY10O00398 339 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 CHEK2O96017 543 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 MMP9P14780 707 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 PRPS1L1P21108 318 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 TGFBR2P37173 567 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 EFNB2P52799 333 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 BIDP55957 195 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 HSF2Q03933 536 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 PLP2Q04941 152 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 HSP90B2PQ58FF3 399 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 MTX3Q5HYI7 312 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 FAM69AQ5T7M9 428 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 Q6ZR03 302 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 OR52P1PQ8NH57 321 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 LRTOMTQ8WZ04 291 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 C3orf30Q96M34 536 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 SLC19A3Q9BZV2 496 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 CLN8Q9UBY8 286 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 CHST2Q9Y4C5 530 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 U3KQK5 164 aa12.84□□□□□ -0.35
ALYREF-204ENST00000512673 LYSTQ99698 3801 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 C5orf49A4QMS7 147 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 LRRN3E7EW58 273 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 FZD7O75084 574 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 FARS2O95363 451 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 PTHP01270 115 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 VSIG10L2P0DP72 767 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 G6PDP11413 515 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 TNFRSF1AP19438 455 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 AHCYP23526 432 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 STOMP27105 288 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 PPP1CBP62140 327 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 SLC36A2Q495M3 483 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 DMRTC1Q5HYR2 192 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 LRFN4Q6PJG9 635 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 TIFABQ6ZNK6 161 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 CROCCP2Q86T23 111 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 PEX5LQ8IYB4 626 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 GALNT4Q8N4A0 578 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 PIP4P2Q8N4L2 257 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 FNDC5Q8NAU1 212 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 HIPK4Q8NE63 616 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 PPP1R35Q8TAP8 253 aa12.83□□□□□ -0.36
ALYREF-204ENST00000512673 PPP3R2Q96LZ3 170 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms