RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 PRSS57Q6UWY2 283 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 NHLRC1Q6VVB1 395 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 PTCHD4Q6ZW05 846 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 TUSC5Q8IXB3 177 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 OR52E2Q8NGJ4 325 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 OR8J1Q8NGP2 316 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 OR6K3Q8NGY3 331 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 FAM81AQ8TBF8 368 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ASB10Q8WXI3 467 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM45BQ96B21 275 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 TXNDC15Q96J42 360 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 TSPAN32Q96QS1 320 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 RBP7Q96R05 134 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CMC2Q9NRP2 79 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 MED29Q9NX70 200 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SURF4O15260 269 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SLC43A1O75387 559 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 IGHG1P01857 330 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 THBDP07204 575 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 PPP3CBP16298 524 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 PTH2RP49190 550 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CLRN1P58418 232 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ITGADQ13349 1161 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 MELKQ14680 651 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 NIPAL3Q6P499 406 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 WFDC8Q8IUA0 241 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF100Q8IYN0 542 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 TCEANCQ8N8B7 351 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ZIC4Q8N9L1 334 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 OR4K13Q8NH42 304 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF519Q8TB69 540 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM171Q8WVE6 324 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF566Q969W8 418 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 RASD2Q96D21 266 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 LRR1Q96L50 414 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 MUS81Q96NY9 551 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SNX18Q96RF0 628 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ALG12Q9BV10 488 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 EMC6Q9BV81 110 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 FN3KQ9H479 309 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC42Q9Y546 428 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 NAV3Q8IVL0 2385 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 ABCA2Q9BZC7 2435 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
UBE2B-208ENST00000511807 PRSS37A4D1T9 235 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 SNTNA6NMZ2 147 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 DENRO43583 198 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 TRMUO75648 421 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 PLAUP00749 431 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 AGTR1P30556 359 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 IL5RAQ01344 420 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 CAMK2DQ13557 499 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 MESTQ5EB52 335 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 THEM4Q5T1C6 240 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF691Q5VV52 312 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 MEDAGQ5VYS4 303 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 LEG1Q6P5S2 330 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 STAC2Q6ZMT1 411 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 BEND4Q6ZU67 534 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 USP51Q70EK9 711 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 THAP5Q7Z6K1 395 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 OR6N1Q8NGY5 312 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM163Q8TC26 289 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 APH1AQ96BI3 265 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 OTULINQ96BN8 352 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 PLPPR2Q96GM1 343 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 Q96MT0 163 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 OR2M2Q96R28 347 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 IL4I1Q96RQ9 567 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 NMNAT3Q96T66 252 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 ANKRD60Q9BZ19 345 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 GSX2Q9BZM3 304 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 ACTR6Q9GZN1 396 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 C12orf49Q9H741 205 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 CLN6Q9NWW5 311 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.96□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 PRKYO43930 277 aa9.95□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 KRT33AO76009 404 aa9.95□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF432O94892 652 aa9.95□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 CLIC3O95833 236 aa9.95□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 MYF6P23409 242 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms