RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495490.6

TIMM17B-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, human

TSL 5 BASIC

Gene TIMM17B, Length 939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM17B-208	ENST00000495490	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	BGN	P21810	368 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	EPHA3	P29320	983 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	APLNR	P35414	380 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	LIPA	P38571	399 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	PAX2	Q02962	417 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	MELK	Q14680	651 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	PARP8	Q8N3A8	854 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	SPIC	Q8N5J4	248 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	MCHR2	Q969V1	340 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	DIRC2	Q96SL1	478 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	RMND5A	Q9H871	391 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	C5orf58	C9J3I9	102 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	CLIC1	O00299	241 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	IDO1	P14902	403 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	STOM	P27105	288 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	NCALD	P61601	193 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	RELB	Q01201	579 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	ZNF74	Q16587	644 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	C10orf111	Q8N326	155 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	LRRC18	Q8N456	261 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	GTF2H4	Q92759	462 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	UPRT	Q96BW1	309 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	SEPHS2	Q99611	448 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	MGRN1	O60291	552 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	ICMT	O60725	284 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	OR6A2	O95222	327 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	CCNO	P22674	350 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	STX3	Q13277	289 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	REEP3	Q6NUK4	255 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	WDR93	Q6P2C0	686 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	OR4F5	Q8NH21	305 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	NFKBID	Q8NI38	313 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	ZNF347	Q96SE7	839 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	BEX1	Q9HBH7	125 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	MSL2	Q9HCI7	577 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TIMM17B-208	ENST00000495490		H3BSA7	217 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490		M0QZ24	198 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	HDAC3	O15379	428 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	RNF13	O43567	381 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	IGHG1	P01857	330 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	RAG2	P55895	527 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	KRTAP10-3	P60369	221 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	BTG1	P62324	171 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	CDK6	Q00534	326 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	HSF2	Q03933	536 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	BST1	Q10588	318 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	CDK5R2	Q13319	367 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	ZMYND11	Q15326	602 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	HHAT	Q5VTY9	493 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	NABP1	Q96AH0	204 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	ARHGDIG	Q99819	225 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	SIAE	Q9HAT2	523 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	C5orf49	A4QMS7	147 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TIMM17B-208	ENST00000495490	SRRM5	B3KS81	715 aa		13.57	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms