RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492887.5

FDPS-218, Transcript of farnesyl diphosphate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene FDPS, Length 554 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPS-218ENST00000492887 LINC01590Q5TEZ4 76 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 GPR107Q5VW38 600 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 SLC18B1Q6NT16 456 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 KRT77Q7Z794 578 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 SIAH3Q8IW03 269 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 GLB1L2Q8IW92 636 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 WDFY1Q8IWB7 410 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 GCNT2Q8N0V5 402 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 YIPF7Q8N8F6 280 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 OR2T27Q8NH04 317 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 ZNRF4Q8WWF5 429 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 C11orf40Q8WZ69 217 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 TMEM54Q969K7 222 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 TMIGD2Q96BF3 282 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 APH1AQ96BI3 265 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 C4orf36Q96KX1 117 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 OR5M11Q96RB7 305 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 TTYH2Q9BSA4 534 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 CDCA4Q9BXL8 241 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 SLC25A18Q9H1K4 315 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 PARPBPQ9NWS1 579 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 ERVK13-1Q9NX77 482 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 KCNG2Q9UJ96 466 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 COPS3Q9UNS2 423 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 ZNF175Q9Y473 711 aa7.13□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 SHANK1Q9Y566 2161 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 TMEM129A0AVI4 362 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 TRIM64CA6NLI5 447 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 AHRRA9YTQ3 701 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 ZNF587BE7ETH6 402 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 PRRG2O14669 202 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 WDR1O75083 606 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 UPK3AO75631 287 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 SEC14L2O76054 403 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 MPZL1O95297 269 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 TGM6O95932 706 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 YES1P07947 543 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 ADRA2AP08913 450 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 SFTPCP11686 197 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 GABRA1P14867 456 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 CD36P16671 472 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 MSR1P21757 451 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 NR4A1P22736 598 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 AGTR1P30556 359 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 CDAP32320 146 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 CD79BP40259 229 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 CAPZA2P47755 286 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 GALEQ14376 348 aa7.12□□□□□ -1.27
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FDPS-218ENST00000492887 SPHARQ15513 63 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 CEACAM16Q2WEN9 425 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 UBE2UQ5VVX9 321 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 XAF1Q6GPH4 301 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 OR2A2Q6IF42 318 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 ZNF544Q6NX49 715 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 KLHL24Q6TFL4 600 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 RPTNQ6XPR3 784 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 DPY19L4Q7Z388 723 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 KLBQ86Z14 1044 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 TIGD4Q8IY51 512 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 C20orf196Q8IYI0 205 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 LRRC18Q8N456 261 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 RFLNBQ8N5W9 214 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 NANOGP1Q8N7R0 232 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 Q8NA96 180 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 OR52N1Q8NH53 320 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 HTRA1Q92743 480 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 TMEM45BQ96B21 275 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 DDOQ99489 341 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 MNTQ99583 582 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 MGLLQ99685 303 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 YIPF3Q9GZM5 350 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 PRORYQ9H606 182 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 CRLF2Q9HC73 371 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 EMC7Q9NPA0 242 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 TRIM36Q9NQ86 728 aa7.12□□□□□ -1.27
FDPS-218ENST00000492887 CENPMQ9NSP4 180 aa7.12□□□□□ -1.27
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