RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 TCN2P20062 427 aa14.98□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 EIF1P41567 113 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 SELENBP1Q13228 472 aa14.98□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 OR7E24Q6IFN5 339 aa14.98□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 MZT2BQ6NZ67 158 aa14.98□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 MDGA2Q7Z553 956 aa14.98□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 GPAT4Q86UL3 456 aa14.98□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 SLC26A10Q8NG04 563 aa14.98□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 ABHD1Q96SE0 405 aa14.98□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 ANKRD10Q9NXR5 420 aa14.98□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 SPATA2Q9UM82 520 aa14.98□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 TRABD2BA6NFA1 517 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 LYRM1O43325 122 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 ZNF254O75437 659 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 ZNF432O94892 652 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 WNT11O96014 354 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 ROM1Q03395 351 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 PYHIN1Q6K0P9 492 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 GPR148Q8TDV2 347 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 TMEM106AQ96A25 262 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 TCFL5Q9UL49 500 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 V9GY05 133 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 AIPO00170 330 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 LANCL1O43813 399 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 SLC43A1O75387 559 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 IGHEP01854 428 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 PTGS2P35354 604 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 UEVLDQ8IX04 471 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 RNF128Q8TEB7 428 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 RFT1Q96AA3 541 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 ZBTB8AQ96BR9 441 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 GNRHR2Q96P88 292 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 FANCFQ9NPI8 374 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 HPF1Q9NWY4 346 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.97□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 PNPP00491 289 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 JMJD7P0C870 316 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 ADH6P28332 368 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 RIDAP52758 137 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 MLF1P58340 268 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 FDX2Q6P4F2 183 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 ASB18Q6ZVZ8 466 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 LINC00346Q8IVM7 164 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 OR52N5Q8NH56 324 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 CT55Q8WUE5 264 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 LOXL4Q96JB6 756 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 LRP12Q9Y561 859 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 R4GN57 208 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 MED12Q93074 2177 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 MEIOCA2RUB1 952 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 RAD1O60671 282 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 DPP4P27487 766 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 CLDN12P56749 244 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 TEX30Q5JUR7 227 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 PLA2G2CQ5R387 149 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 SLC22A10Q63ZE4 541 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 TMEM225Q6GV28 225 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 PAQR8Q8TEZ7 354 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 PPP1R14AQ96A00 147 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.96□□□□□ -0.01
TOM1-216ENST00000492723 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 GPR171O14626 319 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 CD63P08962 238 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 UBE2NLQ5JXB2 153 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 ZNF544Q6NX49 715 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 TMEM81Q6P7N7 255 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 PLET1Q6UQ28 207 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 DCXRQ7Z4W1 244 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 DNAAF1Q8NEP3 725 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 RBP7Q96R05 134 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 RNF121Q9H920 327 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 PROK2Q9HC23 129 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 A0A087WZY1 265 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 ZNF814B7Z6K7 855 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 MAS1P04201 325 aa14.95□□□□□ -0.02
TOM1-216ENST00000492723 CD59P13987 128 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms