RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 SEC14L2O76054 403 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 LY6HO94772 140 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 H1F0P07305 194 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 IFI30P13284 250 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 IFNGR1P15260 489 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 GIFP27352 417 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 PEX2P28328 305 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 RBM34P42696 430 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 CAPZA2P47755 286 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 BIDP55957 195 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 CAMK2DQ13557 499 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 MELKQ14680 651 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 EFNB3Q15768 340 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 LRRC36Q1X8D7 754 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 C3orf36Q3SXR2 165 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 FGD3Q5JSP0 725 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 LINGO2Q7L985 606 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 OFCC1Q8IZS5 231 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 WDR31Q8NA23 367 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 OR4F15Q8NGB8 312 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 OR52J3Q8NH60 311 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 BOD1Q96IK1 185 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 SLC38A2Q96QD8 506 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 BPESC1Q9GZL8 116 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 NTN4Q9HB63 628 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 C20orf141Q9NUB4 165 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 METRNQ9UJH8 293 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 MCIDASD6RGH6 385 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 FZD7O75084 574 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 OR7A10O76100 309 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 PRSS23O95084 383 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 SAGP10523 405 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 THRBP10828 461 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 FUT1P19526 365 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 FUT4P22083 530 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 APEX1P27695 318 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 TUBA1BP68363 451 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 TUBA4AP68366 448 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 ARF1P84077 181 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 LAPTM4AQ15012 233 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 TRAM2Q15035 370 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 CEACAM16Q2WEN9 425 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 TBRG1Q3YBR2 411 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 ZNF730Q6ZMV8 503 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 TUBA1AQ71U36 451 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 SLC35D2Q76EJ3 337 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 PXKQ7Z7A4 578 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 HS3ST5Q8IZT8 346 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 ANKK1Q8NFD2 765 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 OR1K1Q8NGR3 316 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 OR5K1Q8NHB7 308 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 SGMS2Q8NHU3 365 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 EME1Q96AY2 570 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 CIB1Q99828 191 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 ZNF426Q9BUY5 554 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 ULBP2Q9BZM5 246 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 LINC00470Q9BZP3 86 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 PLK3Q9H4B4 646 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 CRLF2Q9HC73 371 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 GPR35Q9HC97 309 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 OAZ3Q9UMX2 235 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PRG6 482 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 ZNF432O94892 652 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 F13BP05160 661 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 TACSTD2P09758 323 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 OR4A8P0C604 315 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 ASAH2BP0C7U1 165 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 DAOP14920 347 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 CFPP27918 469 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 AQP2P41181 271 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 CSNK1A1P48729 337 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 ARHGDIAP52565 204 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 SMIM11AP58511 58 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 MST1LQ2TV78 715 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 PHYHD1Q5SRE7 291 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 RRM2BQ7LG56 351 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 NRMQ8IXM6 262 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 TMEM123Q8N131 208 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 SVOPLQ8N434 492 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 OR4C15Q8NGM1 316 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 NRG4Q8WWG1 115 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 BPIFA2Q96DR5 249 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 DHRS1Q96LJ7 313 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 C9orf16Q9BUW7 83 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-210ENST00000442481 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms