RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 COQ8AQ8NI60 647 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST1H2ACQ93077 130 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 CXorf58Q96LI9 332 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF25Q9UIL4 384 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 NSA2O95478 260 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 PROS1P07225 676 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF35P13682 527 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 DLX5P56178 289 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD16Q6P6B7 361 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 OR51S1Q8NGJ8 323 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 ADOQ96SZ5 270 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 FXYD6Q9H0Q3 95 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 OPN4Q9UHM6 478 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM131Q92545 1883 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 C10orf142B7Z368 130 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 GOSR2O14653 212 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF217O75362 1048 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF432O94892 652 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 PLGP00747 810 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 ITGA5P08648 1049 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 C1QL3Q5VWW1 255 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 GPAT4Q86UL3 456 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1R14AQ96A00 147 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 C4orf45Q96LM5 186 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 DCBLD2Q96PD2 775 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 SDHAF2Q9NX18 166 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 PRKACBP22694 351 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 S100A11P31949 105 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 EGR3Q06889 387 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 WBP1Q96G27 269 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 GAL3ST1Q99999 423 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 RTN4RQ9BZR6 473 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM138Q9NPI0 162 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 GMEB2Q9UKD1 530 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC22A13Q9Y226 551 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 CSF1P09603 554 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 CD27P26842 260 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 HSD17B7P56937 341 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 MEP1BQ16820 701 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 MCHR2Q969V1 340 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 PNPLA2Q96AD5 504 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 OR8D2Q9GZM6 311 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 ARL6Q9H0F7 186 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 ELOVL3Q9HB03 270 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PR77 199 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 IGF2P01344 180 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 EMC4Q5J8M3 183 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 DCAF12L2Q5VW00 463 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 TMUB2Q71RG4 321 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00052Q96N35 136 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 TUBAL3A6NHL2 446 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 TEX46H3BTG2 121 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 CD3DP04234 171 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP2K6P52564 334 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 C2orf76Q3KRA6 126 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 OR7E24Q6IFN5 339 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 PLPP7Q8NBV4 271 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2AK2Q8NG84 335 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 OTOSQ8NHW6 89 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A36Q96CQ1 311 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 TGM7Q96PF1 710 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 GAL3ST4Q96RP7 486 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 REG4Q9BYZ8 158 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 CHST6Q9GZX3 395 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC14CA4D256 554 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 HCRTR2O43614 444 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 RP2O75695 350 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 IL33O95760 270 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 STARD6P59095 220 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM3DQ96BQ1 224 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 NRSN2Q9GZP1 204 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR27Q9NS67 375 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 TAS2R8Q9NYW2 309 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 F5H5P2 479 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 ICOSLGO75144 302 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 WISP1O95388 367 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 NMBP08949 121 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC37A1P57057 533 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 C11orf88Q6PI97 169 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 PRSS42Q7Z5A4 293 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 ATG5Q9H1Y0 275 aa16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms