RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409076.6

SNX13-201, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 3,818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-201ENST00000409076 C10orf90Q96M02 699 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 ADAM29Q9UKF5 820 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 A0A087WV62 115 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 TMEM82A0PJX8 343 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 SERINC4A6NH21 518 aa7.56□□□□□ -1.2
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SNX13-201ENST00000409076 ZNF806P0C7X5 589 aa7.56□□□□□ -1.2
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SNX13-201ENST00000409076 HLA-DOBP13765 273 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 LIMK1P53667 647 aa7.56□□□□□ -1.2
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SNX13-201ENST00000409076 MOGAT2Q3SYC2 334 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 Q499Y3 187 aa7.56□□□□□ -1.2
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SNX13-201ENST00000409076 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 PRSS42Q7Z5A4 293 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 TMEM17Q86X19 198 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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SNX13-201ENST00000409076 KCNJ15Q99712 375 aa7.56□□□□□ -1.2
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SNX13-201ENST00000409076 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 PLCL2Q9UPR0 1127 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 A0A0B4J2E0 115 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 A0A1B0GX12 115 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 CCDC85CA6NKD9 419 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 BRINP1O60477 761 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 AGR2O95994 175 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 RNH1P13489 461 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 GLULP15104 373 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 C4BPBP20851 252 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 NME2P22392 152 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 NUDT1P36639 197 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 FRKP42685 505 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 BTG1P62324 171 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 PLCXD2Q0VAA5 305 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 RNLSQ5VYX0 342 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 NPSR1Q6W5P4 371 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 OR2L13Q8N349 312 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 GPR148Q8TDV2 347 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 TOMM40LQ969M1 308 aa7.55□□□□□ -1.2
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SNX13-201ENST00000409076 TIMP4Q99727 224 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 TEX101Q9BY14 249 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 KLF15Q9UIH9 416 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 MAFFQ9ULX9 164 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 ZNF407Q9C0G0 2248 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 A0A1W2PP11 408 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 CPED1A4D0V7 1026 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 ZNF878C9JN71 531 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 ADH1BP00325 375 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 CDAP32320 146 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 ATP1B3P54709 279 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 IL13RA1P78552 427 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 TPRA1Q86W33 373 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 OR2AK2Q8NG84 335 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 ZNF649Q9BS31 505 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 PPA2Q9H2U2 334 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 PRODH2Q9UF12 536 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 OR14I1A6ND48 311 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 TMEM150CB9EJG8 249 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 AIPO00170 330 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 TNFP01375 233 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 ITGA5P08648 1049 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 FAM157BP0CG42 384 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 SULT1A3P0DMM9 295 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 SULT1A4P0DMN0 295 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 CFL1P23528 166 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 ID4P47928 161 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 DIO1P49895 249 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX13-201ENST00000409076 GPR143P51810 404 aa7.55□□□□□ -1.2
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