RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CREBRFQ8IUR6 639 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UBQLNLQ8IYU4 475 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CDK20Q8IZL9 346 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF525Q8N782 197 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C15orf54Q8N8G6 183 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM75Q8N9X5 138 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR8D4Q8NGM9 314 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C15orf40Q8WUR7 153 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TAF4BQ92750 862 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CORO2AQ92828 525 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CDS1Q92903 461 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC35C1Q96A29 364 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PNPLA2Q96AD5 504 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C3orf30Q96M34 536 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00052Q96N35 136 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TTC25Q96NG3 672 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WFDC10AQ9H1F0 79 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MFSD1Q9H3U5 465 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARMT1Q9H993 441 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIM39Q9HCM9 518 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IFT46Q9NQC8 304 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADPRHL2Q9NX46 363 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIM10Q9UDY6 481 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MTMR7Q9Y216 660 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ASF1AQ9Y294 204 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMED3Q9Y3Q3 217 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PATJQ8NI35 1801 aa-4.35□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CEP170Q5SW79 1584 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C11orf94C9JXX5 98 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TFECO14948 347 aaPredicted RBP-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCL25O15444 150 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FGF16O43320 207 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ORC4O43929 436 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NCR1O76036 304 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HAUS5O94927 633 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LYPLA2O95372 231 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AGR2O95994 175 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MMEP08473 750 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HOXC6P09630 235 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HTN1P15515 57 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NDUFS1P28331 727 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CTSKP43235 329 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAPK9P45984 424 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UBA52P62987 128 aaKnown RBP-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SEMG2Q02383 582 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TFF3Q07654 80 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRDNQ13061 729 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PAK1Q13153 545 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAPK14Q16539 360 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NKG7Q16617 165 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DEFB116Q30KQ4 102 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PIGYQ3MUY2 71 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PAGE3Q5JUK9 113 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCID2Q5JVF3 399 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM182BQ5T319 152 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IL31Q6EBC2 164 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NIPAL1Q6NVV3 410 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EBLN2Q6P2I7 272 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TTC27Q6P3X3 843 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF783Q6ZMS7 281 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KLBQ86Z14 1044 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GLB1L2Q8IW92 636 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IQCF2Q8IXL9 164 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CMTM4Q8IZR5 234 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NKAIN3Q8N8D7 197 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF454Q8N9F8 522 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM145Q8NBT3 493 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C3orf58Q8NDZ4 430 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GSTCDQ8NEC7 633 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 APPL2Q8NEU8 664 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NOXO1Q8NFA2 376 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR4N2Q8NGD1 307 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 JDP2Q8WYK2 163 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TANKQ92844 425 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATP6V0A1Q93050 837 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SUCLG2Q96I99 432 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NICN1Q9BSH3 213 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ITPAQ9BY32 194 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SAMD10Q9BYL1 202 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AAMDCQ9H7C9 122 aa-4.36□□□□□ -3.11
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IL23AQ9NPF7 189 aa-4.36□□□□□ -3.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms