RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ASB10Q8WXI3 467 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FAM168AQ92567 244 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 PLK3Q9H4B4 646 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF442Q9H7R0 627 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 REEP1Q9H902 201 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 INIPQ9NRY2 104 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 AURKCQ9UQB9 309 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 POMPQ9Y244 141 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 A0A096LNT2 108 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 VSTM5A8MXK1 200 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 EFCAB9A8MZ26 197 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 J3KTA2 159 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 hCG_2039718K7EN88 272 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 GNGT2O14610 69 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ACOT8O14734 319 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 DHHO43323 396 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 CD5LO43866 347 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MGRN1O60291 552 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS23O95084 383 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 QDPRP09417 244 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TSPAN19P0C672 248 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 IFI30P13284 250 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A16P16260 332 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 NR4A1P22736 598 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF84P51523 738 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGDIAP52565 204 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 RAB1AP62820 205 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 VLDLRP98155 873 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MYBPC1Q00872 1141 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 GALK2Q01415 458 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 PRKCDQ05655 676 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 RUNX1T1Q06455 604 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 HIST3H3Q16695 136 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ALG10Q5BKT4 473 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf146Q5VVC0 180 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 OAFQ86UD1 273 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SKA3Q8IX90 412 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 NRMQ8IXM6 262 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SVOPLQ8N434 492 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SYT14Q8NB59 555 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 OR4K5Q8NGD3 323 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MCHR2Q969V1 340 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF75AQ96N20 296 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SEPHS2Q99611 448 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SH3GL3Q99963 347 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 RHCGQ9UBD6 479 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SLC7A8Q9UHI5 535 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 V9GYQ6 96 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 RTTNQ86VV8 2226 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ANK2Q01484 3957 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 STAB1Q9NY15 2570 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 A0A087WUU8 490 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ARRDC5A6NEK1 342 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 A6NIZ1 184 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TNFRSF11BO00300 401 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FFAR1O14842 300 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 AHCYL1O43865 530 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 GPRIN2O60269 458 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 OR10H3O60404 316 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TRMUO75648 421 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SLC2A10O95528 541 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 IGHMP01871 453 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 PATE4P0C8F1 98 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF35P13682 527 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ACADSP16219 412 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MAKP20794 623 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 GSTM3P21266 225 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FUT4P22083 530 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FPR3P25089 353 aa6.61□□□□□ -1.35
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