RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 IRF2P14316 349 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 CD1DP15813 335 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 AK4P27144 223 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 PTPN6P29350 595 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 CTBP2P56545 445 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 TMEM33P57088 247 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 RNLSQ5VYX0 342 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 ADGRG7Q96K78 797 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 LAT2Q9GZY6 243 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 GPR27Q9NS67 375 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 DOK5Q9P104 306 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 PRODH2Q9UF12 536 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 FBXL4Q9UKA2 621 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 C20orf202A1L168 122 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 LANCL1O43813 399 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 MGMTP16455 207 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 NDUFA6P56556 154 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 DOC2BQ14184 412 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 AGERQ15109 404 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 RBBP7Q16576 425 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 TMEM52BQ4KMG9 183 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 GUSBP11Q6P575 273 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 OR8U1Q8NH10 309 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 OR56B4Q8NH76 319 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 ESAMQ96AP7 390 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 TEX101Q9BY14 249 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 OR10A5Q9H207 317 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 TREX1Q9NSU2 369 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 PPT2Q9UMR5 302 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 SMIM30A4D0T7 59 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 M0R129 80 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 FLRT2O43155 660 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 SH3BGRLO75368 114 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 GLCEO94923 617 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 EML2O95834 649 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 CRISP1P54107 249 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 ITGA1P56199 1179 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 XKR7Q5GH72 579 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 NRROSQ86YC3 692 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 C10orf111Q8N326 155 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 OR52B6Q8NGF0 335 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 NUS1Q96E22 293 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 APOLD1Q96LR9 279 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 CDK15Q96Q40 435 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 FCRL5Q96RD9 977 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 INTS14Q96SY0 518 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 APOOQ9BUR5 198 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 SLC32A1Q9H598 525 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 RERGLQ9H628 205 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-202ENST00000349984 A0A1W2PPH5 198 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-202ENST00000349984 CPED1A4D0V7 1026 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-202ENST00000349984 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CCR6-202ENST00000349984 H7BY64 318 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms