RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 PRSS35Q8N3Z0 413 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 LRRC75AQ8NAA5 344 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 OR10AC1Q8NH08 325 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 PTX4Q96A99 478 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 SLC41A2Q96JW4 573 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 PRRT1Q99946 306 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 PTDSS2Q9BVG9 487 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 GPR174Q9BXC1 333 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 TWSG1Q9GZX9 223 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa10.2□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 MEIS3P1A6NDR6 274 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 OR52A4PA6NMU1 304 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 COLCA2A8K830 154 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 LINC00587B1AMM8 73 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 UBE2CO00762 179 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 LDLRAD4O15165 306 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 FABP1P07148 127 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 CD14P08571 375 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ELOCQ15369 112 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 EMC4Q5J8M3 183 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 FBXO42Q6P3S6 717 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 MISPQ8IVT2 679 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 BPIFB2Q8N4F0 458 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 OR51A4Q8NGJ6 313 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ARSGQ96EG1 525 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 OR2A5Q96R48 311 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 CDC6Q99741 560 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 CFHR5Q9BXR6 569 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ATG5Q9H1Y0 275 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 WDR76Q9H967 626 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 FBXO4Q9UKT5 387 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 C5orf52A6NGY3 159 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 DBX1A6NMT0 343 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 YKT6O15498 198 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 TNFSF14O43557 240 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 FGF17O60258 216 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 AKR7A3O95154 331 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ADH1CP00326 375 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 SDHAP31040 664 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 PTGFRP43088 359 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 KIR3DL2P43630 455 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 SLC6A9P48067 706 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 AKR1C2P52895 323 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 RAB5BP61020 215 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 AKR1C1Q04828 323 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 MESP2Q0VG99 397 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 MST1LQ2TV78 715 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 DEFB134Q4QY38 66 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 FAM209BQ5JX69 171 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ASPHD2Q6ICH7 369 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 RTL10Q7L3V2 364 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 JAZF1Q86VZ6 243 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 OR4K17Q8NGC6 315 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 PHB2Q99623 299 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 NRIP2Q9BQI9 281 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 CYTL1Q9NRR1 136 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 LAMP5Q9UJQ1 280 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 KCNK6Q9Y257 313 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 VSIG4Q9Y279 399 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa10.19□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 C9orf170A2RU37 121 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 M0QYG6 137 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 CYR61O00622 381 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 GNB5O14775 395 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ZNF208O43345 1280 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ALOX12BO75342 701 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 CRHP06850 196 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 RHOP08100 348 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 CSF2RAP15509 400 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 FSTP19883 344 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 PSMB6P28072 239 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 PSG6Q00889 435 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 PEA15Q15121 130 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 RNF212Q495C1 297 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 IGSF11Q5DX21 431 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 BEX5Q5H9J7 111 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 TEX30Q5JUR7 227 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 PLPP4Q5VZY2 271 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 AWAT2Q6E213 333 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 CNKSR3Q6P9H4 555 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 DEFB128Q7Z7B8 93 aa10.18□□□□□ -0.78
GINS3-202ENST00000328514 C15orf54Q8N8G6 183 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms