RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC18Q8N456 261 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 FNDC8Q8TC99 324 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q96M85 177 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 MUC13Q9H3R2 512 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLK3Q9H4B4 646 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIAEQ9HAT2 523 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 AURKCQ9UQB9 309 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 RTTNQ86VV8 2226 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 UNC119BA6NIH7 251 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF223E7ERA6 249 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPRIN2O60269 458 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPR2P20594 1047 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 MSMPQ1L6U9 139 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTX3Q5HYI7 312 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLEC9AQ6UXN8 241 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCAS4Q8TDM0 211 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF570Q96NI8 536 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 SORCS2Q96PQ0 1159 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBP7Q96R05 134 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDEL1Q9GZM8 345 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF121Q9H920 327 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAS2R1Q9NYW7 299 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRHPRQ9UBQ7 328 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 MGRN1O60291 552 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 LY6G6DO95868 133 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 HEXAP06865 529 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGEA2P43356 314 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFNA4P52798 201 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 MS4A2Q01362 244 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q71RC1 249 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZER1Q7Z7L7 766 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 SVOPLQ8N434 492 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF525Q8N782 197 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC30A7Q8NEW0 376 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASD2Q96D21 266 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf21Q9H246 121 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 NRIP3Q9NQ35 241 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL20RAQ9UHF4 553 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAV3Q8IVL0 2385 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 FN1P02751 2386 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM129A0AVI4 362 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC22A23A1A5C7 686 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM171A2A8MVW0 826 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 LY6HO94772 140 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 FPR3P25089 353 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLRXP35754 106 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPOXP50336 477 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 GALK2Q01415 458 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 SGCAQ16586 387 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM27BQ5VT28 67 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHFR2Q86XF0 187 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 FANK1Q8TC84 345 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLPTM1LQ96KA5 538 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 REG4Q9BYZ8 158 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf198Q9H425 327 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC7A8Q9UHI5 535 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPEF1Q9Y4P9 236 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PPL8 197 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRSS37A4D1T9 235 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 XKRYO14609 159 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10H3O60404 316 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBOX5O94941 541 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCL2P13500 99 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF32P17041 273 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 LAP3P28838 519 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 SDHAP31040 664 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR139Q6DWJ6 353 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMARCD3Q6STE5 483 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLEC2AQ6UVW9 174 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10H5Q8NGA6 315 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASB9Q96DX5 294 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 DOK1Q99704 481 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGIXQ9H6Y5 334 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 CMAHPQ9Y471 501 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A096LNT2 108 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 VSTM5A8MXK1 200 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 AHCYL1O43865 530 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNAP29O95721 258 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 TXNDC12O95881 172 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 F12P00748 615 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 CST2P09228 141 aa16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms