RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 PRRC1Q96M27 445 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 FNDC11Q9BVV2 318 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 ACTR6Q9GZN1 396 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 ACACAQ13085 2346 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 A0A1B0GVC2 190 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 A6NIN4 97 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 H3BN98 237 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 FFAR1O14842 300 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 FADS1O60427 444 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 ECDO95905 644 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 H1F0P07305 194 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
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GINS3-201ENST00000318129 NPR2P20594 1047 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 CD79BP40259 229 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 ERVK-25P63136 954 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 Q0VFX4 171 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 MICBQ29980 383 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 IDNKQ5T6J7 187 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 FNDC7Q5VTL7 733 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 Q6ZTK2 550 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 TOMM5Q8N4H5 51 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 OR5M9Q8NGP3 310 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 OR6S1Q8NH40 331 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 MCHR1Q99705 422 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 TMED9Q9BVK6 235 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 SCNM1Q9BWG6 230 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 CHIAQ9BZP6 476 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 TRIM2Q9C040 744 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 LAT2Q9GZY6 243 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 BEX1Q9HBH7 125 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 TVP23BQ9NYZ1 205 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 MSRB2Q9Y3D2 182 aa9.2□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 GNB5O14775 395 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 SUSD5O60279 629 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 RP2O75695 350 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 LIMS3P0CW19 117 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 LIMS4P0CW20 117 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 RAB3BP20337 219 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 S100A11P31949 105 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 EIF1P41567 113 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 FBXW4P57775 412 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 TAS2R41P59536 307 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 CLN3Q13286 438 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 SEC23BQ15437 767 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 PYHIN1Q6K0P9 492 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 VASH2Q86V25 355 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 POGLUT1Q8NBL1 392 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 CLEC1AQ8NC01 280 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 FAM71CQ8NEG0 241 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 SFT2D1Q8WV19 159 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 LRR1Q96L50 414 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 WFDC6Q9BQY6 131 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 FN3KQ9H479 309 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 ANKRD19PQ9H560 264 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 TMEM27Q9HBJ8 222 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 SDHAF3Q9NRP4 125 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 FLRT3Q9NZU0 649 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 A4GNTQ9UNA3 340 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 WASF3Q9UPY6 502 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 ZNF264O43296 627 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 SGCEO43556 437 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 FRS3O43559 492 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 PEX14O75381 377 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 SIX6O95475 246 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 RLN2P04090 185 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 THBS2P35442 1172 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 RFC3P40938 356 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 SLC6A8P48029 635 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 ARHGDIBP52566 201 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 ZNF136P52737 540 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 EFNB1P98172 346 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 ST3GAL3Q11203 375 aa9.19□□□□□ -0.94
GINS3-201ENST00000318129 RAB40BQ12829 278 aa9.19□□□□□ -0.94
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