RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284073.6

MSI2-201, Transcript of musashi RNA binding protein 2, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSI2, Length 6,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI2-201ENST00000284073 CTNSO60931 367 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 RFX2P48378 723 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 NR0B2Q15466 257 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 FAM27D1Q5T7N8 215 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 GPR119Q8TDV5 335 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 A0A1W2PPQ1 181 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 C1SP09871 688 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 APLNRP35414 380 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 THBS3P49746 956 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 ZNF90Q03938 601 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 ZNF528Q3MIS6 628 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 AMDHD1Q96NU7 426 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 PRLHRP49683 370 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 SRPXP78539 464 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 PKDCCQ504Y2 493 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 FAM173AQ9BQD7 235 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 RSRP1Q9BUV0 290 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 TAS2R4Q9NYW5 299 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 B4GALT7Q9UBV7 327 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 RAB27BO00194 218 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 LIPNQ5VXI9 398 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 B3GNT9Q6UX72 402 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 IL34Q6ZMJ4 242 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 OR5AP2Q8NGF4 316 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 OR13D1Q8NGV5 346 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 Q96M85 177 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 MTCH1Q9NZJ7 389 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 CLCF1Q9UBD9 225 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa14.55□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 BCL2L11O43521 198 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 FCER1GP30273 86 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 OR4F5Q8NH21 305 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 OR4F4Q96R69 305 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 ABHD6Q9BV23 337 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 ZNF586Q9NXT0 402 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 CLDND1Q9NY35 253 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 C3P01024 1663 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 BTBD17A6NE02 478 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 MCRIP1C9JLW8 97 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 M0QZQ0 153 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 DUX1O43812 170 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 SUSD5O60279 629 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 TIMP2P16035 220 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 FAM219BQ5XKK7 198 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 BATF2Q8N1L9 274 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 UBTD2Q8WUN7 234 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 SNRPGP15A8MWD9 76 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 F2RL1P55085 397 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 LINC00303Q3SY05 128 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 CSF3RQ99062 836 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 MAP3K3Q99759 626 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 A0A087WUU8 490 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 LY86O95711 162 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 BAMBIQ13145 260 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 C9orf152Q5JTZ5 239 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 DTD2Q96FN9 168 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 LRFN5Q96NI6 719 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 MMP24Q9Y5R2 645 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 ZNF264O43296 627 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 MPGP29372 298 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 FAM209AQ5JX71 171 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 MFSD4AQ8N468 514 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 LINC00052Q96N35 136 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 PARD6AQ9NPB6 346 aa14.54□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 G3V3Q6 166 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 SLC2A1P11166 492 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 MAP2K6P52564 334 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 PRSS35Q8N3Z0 413 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 LHX3Q9UBR4 397 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 M0R082 166 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 NAT2P11245 290 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 ZNF250P15622 560 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 CCSMST1Q4G0I0 132 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 ADGRG3Q86Y34 549 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 GLCEO94923 617 aa14.53□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
MSI2-201ENST00000284073 MMP21Q8N119 569 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms