RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 SEH1LQ96EE3 360 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 GABRG3Q99928 467 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 KLHDC3Q9BQ90 382 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ELOVL3Q9HB03 270 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 IFT46Q9NQC8 304 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 SLC17A5Q9NRA2 495 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 RASL12Q9NYN1 266 aa13.49□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 HSPB2A8KAH6 182 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 TNFRSF10CO14798 259 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 RNH1P13489 461 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 TNFRSF4P43489 277 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 TAS2R19P59542 299 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ACTBP60709 375 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ACTG1P63261 375 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 FUT7Q11130 342 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 HSPB2Q16082 182 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 C17orf107Q6ZR85 190 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 TMED4Q7Z7H5 227 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 GALNT16Q8N428 558 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ZNF615Q8N8J6 731 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 PLPP7Q8NBV4 271 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 OR10K1Q8NGX5 313 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 OTOSQ8NHW6 89 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 CCDC107Q8WV48 283 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 PPP1R14AQ96A00 147 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 UPB1Q9UBR1 384 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 SLC22A13Q9Y226 551 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 FAM221BA6H8Z2 402 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 M0QYG6 137 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 RAB3DO95716 219 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 MAOAP21397 527 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 SHHQ15465 462 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 MEP1BQ16820 701 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 FDX2Q6P4F2 183 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 MED25Q71SY5 747 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 TMEM229BQ8NBD8 167 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 STEAP2Q8NFT2 490 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 OR1J4Q8NGS1 313 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 SLC25A28Q96A46 364 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 OR8B4Q96RC9 309 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 WDR13Q9H1Z4 485 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 EPHA6Q9UF33 1036 aa13.48□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 PHYHO14832 338 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 PNPP00491 289 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 CD8AP01732 235 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 CLPSP04118 112 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 HOXB2P14652 356 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 SLC17A1Q14916 467 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 NR0B2Q15466 257 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 SLC35D2Q76EJ3 337 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 BEST3Q8N1M1 668 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 TAAR8Q969N4 342 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 FOXN4Q96NZ1 517 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 POTEKPQ9BYX7 375 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 A0A0D9SG52 128 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ALOX12BO75342 701 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 AGTR1P30556 359 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 TFF2Q03403 129 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 TOMM20Q15388 145 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 TMEM31Q5JXX7 168 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 AVL9Q8NBF6 648 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 OR1J2Q8NGS2 313 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 SLC37A2Q8TED4 501 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 THRSPQ92748 146 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 EDAQ92838 391 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 GAL3ST1Q99999 423 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 FBXO4Q9UKT5 387 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 DOCK8Q8NF50 2099 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa13.47□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 MYO15AQ9UKN7 3530 aa13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 A0A1B0GTI1 187 aa13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 OR5H14A6NHG9 310 aa13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 TTLL8A6PVC2 850 aa13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 SULT1C2O00338 296 aa13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 AMY2AP04746 511 aa13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ZNF735P0CB33 412 aa13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 HPGDP15428 266 aa13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 FNTBP49356 437 aa13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 TMEM205Q6UW68 189 aa13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 PARM1Q6UWI2 310 aa13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 MOB3CQ70IA8 216 aa13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 ZNF627Q7L945 461 aa13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 OR5M8Q8NGP6 311 aa13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 FGF14Q92915 247 aa13.46□□□□□ -0.25
SYP-201ENST00000263233 DNAJA3Q96EY1 480 aa13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms