RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251303.10

SLX1A-201, Transcript of SLX1 homolog A, structure-specific endonuclease subunit, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLX1A, Length 1,091 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1A-201ENST00000251303 CLRN1P58418 232 aa16.05■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 HSF2Q03933 536 aa16.05■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF154Q13106 437 aa16.05■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 BAMBIQ13145 260 aa16.05■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF718Q3SXZ3 478 aa16.05■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 MIDNQ504T8 468 aa16.05■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa16.05■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 SPATA46Q5T0L3 261 aa16.05■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 LRRC18Q8N456 261 aa16.05■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 ANKRD42Q8N9B4 389 aa16.05■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 NOXO1Q8NFA2 376 aa16.05■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF347Q96SE7 839 aa16.05■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 SEPHS2Q99611 448 aa16.05■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 EGLN1Q9GZT9 426 aa16.05■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 IKZF5Q9H5V7 419 aa16.05■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 NANSQ9NR45 359 aa16.05■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF229Q9UJW7 825 aa16.05■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 AUP1Q9Y679 476 aa16.05■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 CMYA5Q8N3K9 4069 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 A0A0G2JK05 382 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 CLDN34H7C241 214 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 MGRN1O60291 552 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 LYPD3O95274 346 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 IGHV2-70P01814 119 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 IGHMP01871 453 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 THY1P04216 161 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 ASAH2BP0C7U1 165 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF12P17014 697 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 CCNOP22674 350 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 SLC6A2P23975 617 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 STOMP27105 288 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 NPTX1Q15818 432 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 SPRNQ5BIV9 151 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 THEM4Q5T1C6 240 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 WDR93Q6P2C0 686 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 SLC25A28Q96A46 364 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 POM121L2Q96KW2 1035 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 ARHGDIGQ99819 225 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 SLITRK2Q9H156 845 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 CENPHQ9H3R5 247 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 NPHS2Q9NP85 383 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 CYSLTR2Q9NS75 346 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 VAPAQ9P0L0 249 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 NPTNQ9Y639 398 aa16.04■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 VWFP04275 2813 aa16.03■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 TRAPPC2LH3BP13 241 aa16.03■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 CD55P08174 381 aa16.03■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 GPX2P18283 190 aa16.03■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 ENTPD8Q5MY95 495 aa16.03■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 C10orf128Q5T292 105 aa16.03■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 SMYD1Q8NB12 490 aa16.03■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 HIPK4Q8NE63 616 aa16.03■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 SLC25A40Q8TBP6 338 aa16.03■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 OR2J1Q9GZK6 312 aa16.03■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 DCAF16Q9NXF7 216 aa16.03■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa16.03■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 INSIG2Q9Y5U4 225 aa16.03■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 LOC100509620A0A075B734 347 aa16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 CENPBD1B2RD01 187 aa16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF32P17041 273 aa16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 LIPAP38571 399 aa16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 PAGE3Q5JUK9 113 aa16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 FUNDC1Q8IVP5 155 aa16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 OR6T1Q8NGN1 323 aa16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 DIRC2Q96SL1 478 aa16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF426Q9BUY5 554 aa16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 SLC19A3Q9BZV2 496 aa16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 SIAEQ9HAT2 523 aa16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 KLHL21Q9UJP4 597 aa16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 CORO2BQ9UQ03 480 aa16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 ANGPT4Q9Y264 503 aa16.02■□□□□ 0.16
SLX1A-201ENST00000251303 C5orf49A4QMS7 147 aa16.01■□□□□ 0.15
SLX1A-201ENST00000251303 A8MXK9 166 aa16.01■□□□□ 0.15
SLX1A-201ENST00000251303 H3BSA7 217 aa16.01■□□□□ 0.15
SLX1A-201ENST00000251303 HIST1H2ABP04908 130 aa16.01■□□□□ 0.15
SLX1A-201ENST00000251303 SBK2P0C263 348 aa16.01■□□□□ 0.15
SLX1A-201ENST00000251303 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SLX1A-201ENST00000251303 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SLX1A-201ENST00000251303 SLC9A3R2Q15599 337 aa16.01■□□□□ 0.15
SLX1A-201ENST00000251303 OCLNQ16625 522 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms