RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm436B1AVU6 407 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hist1h2abC0HKE1 130 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hist1h2acC0HKE2 130 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hist1h2adC0HKE3 130 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hist1h2aeC0HKE4 130 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hist1h2agC0HKE5 130 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hist1h2aiC0HKE6 130 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hist1h2anC0HKE7 130 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hist1h2aoC0HKE8 130 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hist1h2apC0HKE9 130 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm8973D3YX71 104 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vmn2r69G3XA45 850 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr1360K9J6X0 313 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 P01852 173 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cdk1P11440 297 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Klrb1cP27814 223 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gpr85P60894 370 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Crybb2P62696 205 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pgap1Q3UUQ7 922 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Orm1Q60590 207 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 HlxQ61670 476 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr1359Q7TQU5 313 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr884Q7TRE1 309 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 IfnkQ7TSL0 199 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CblcQ80XL1 496 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hist3h2aQ8BFU2 130 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sdhaf4Q8BTE0 104 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hist1h2afQ8CGP5 130 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hist1h2ahQ8CGP6 128 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hist1h2akQ8CGP7 130 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr108Q8VFA1 320 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr788Q8VFI0 311 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr378Q8VGT2 314 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Krt88Q9CPR6 171 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CsQ9CZU6 464 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Alg2Q9DBE8 415 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ndel1Q9ERR1 345 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cln8Q9QUK3 288 aa16.4■□□□□ 0.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arid1aA2BH40 2283 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr287E9PZS7 322 aa16.39■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fcer1aP20489 250 aa16.39■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hsd3b2P26149 373 aa16.39■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rpl18P35980 188 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 HbegfQ06186 208 aa16.39■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dvl3Q61062 716 aa16.39■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc26a11Q80ZD3 593 aa16.39■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tmem30bQ8BHG3 353 aa16.39■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mblac1Q8BWY4 260 aa16.39■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 ShfQ8CG80 238 aa16.39■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lsm14aQ8K2F8 462 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nt5dc2Q91X76 390 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ddah2Q99LD8 285 aa16.39■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 BptfA2A654 3036 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm17949A0A1B0GRV7 212 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr1366A0A1W2P740 328 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm21936A0A1Y7VJE9 144 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm5788A0A1Y7VK80 144 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm4787B2RUD9 748 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Bbip1J3QMK2 67 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm5039J3QNT6 144 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gpr52P0C5J4 361 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mst1P26928 716 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cnr1P47746 473 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abcd3P55096 659 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pcbp4P57724 403 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PkibQ04758 92 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 LvrnQ2KHK3 559 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vmn1r11Q3SXA2 299 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm2016Q3TQZ4 144 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Isg20l2Q3U1G5 368 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Klhl21Q3U410 597 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm8332Q3UTA4 144 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pate2Q3UW31 111 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Foxd3Q61060 465 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 SrmsQ62270 496 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 DraxinQ6PAL1 343 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abhd17bQ7M759 288 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm5662Q8BX20 144 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tmem200aQ8C817 491 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Micu2Q8CD10 432 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ntng2Q8R4F1 589 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr821Q8VG45 310 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr676Q8VGZ9 317 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fgfrl1Q91V87 529 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 AldobQ91Y97 364 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 MrgprdQ91ZB8 321 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slco1a6Q99J94 670 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Q99LU8 229 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tspan31Q9CQ88 210 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arl5bQ9D4P0 179 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Acox1Q9R0H0 661 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ranbp2Q9ERU9 3053 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zfp534A2A7A1 661 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm5916G5E8W5 102 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mfsd4b4J3QNS5 503 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vmn2r36K7N741 852 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vmn2r28L7N203 852 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gdf1P20863 357 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Clec10aP49300 304 aa16.38■□□□□ 0.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rps7P62082 194 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.8 ms