RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 PXKQ7Z7A4 578 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 ZER1Q7Z7L7 766 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 SKA3Q8IX90 412 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 C4orf33Q8N1A6 199 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 MNS1Q8NEH6 495 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 SSMEM1Q8WWF3 244 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 TAAR8Q969N4 342 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF566Q969W8 418 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 SLC47A1Q96FL8 570 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 SLC41A3Q96GZ6 507 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 PLEKHA8Q96JA3 519 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 CHIAQ9BZP6 476 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM38BQ9NVV0 291 aa7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 CLPXO76031 633 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 HPRP00739 348 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 CSF1P09603 554 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 HLA-DOBP13765 273 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 RPS2P15880 293 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 CBLP22681 906 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 AHCYP23526 432 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 ALDH3A1P30838 453 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF84P51523 738 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 DSTNP60981 165 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 RELBQ01201 579 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 DEFB112Q30KQ8 113 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 TTMPQ5BVD1 217 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 FAM91A1Q658Y4 838 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 Q6ZPA2 131 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 KIRREL3Q8IZU9 778 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF283Q8N7M2 679 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 OR4K5Q8NGD3 323 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 MRAPQ8TCY5 172 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 DYRK2Q92630 601 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 SH3GL3Q99963 347 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 GLTPQ9NZD2 209 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 PYCARDQ9ULZ3 195 aa7.26□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 PLXNB1O43157 2135 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 A0A0G2JPF8 293 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 A0A1B0GWA3 101 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 SMIM23A6NLE4 172 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 CEACAM18A8MTB9 384 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 MS4A18H0YCH9 400 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 IFNL4K9M1U5 179 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 SURF4O15260 269 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 MGRN1O60291 552 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 PIP5K1CO60331 668 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 OR6A2O95222 327 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 MT-ATP6P00846 226 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 CCNOP22674 350 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 CD80P33681 288 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 CRATP43155 626 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 BIDP55957 195 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 PROK1P58294 105 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 GNB2P62879 340 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 ZMYND11Q15326 602 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 FAM189A2Q15884 450 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 MS4A18Q3C1V0 323 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 MTX3Q5HYI7 312 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 COX20Q5RI15 118 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 ULK3Q6PHR2 472 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 Q6YL49 198 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF621Q6ZSS3 439 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 JAZF1Q86VZ6 243 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 CLIP4Q8N3C7 705 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 C10orf53Q8N6V4 93 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 HIPK4Q8NE63 616 aa7.25□□□□□ -1.25
HLA-B-257ENST00000640094 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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