RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635865.1

ATRX-220, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-220ENST00000635865 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 CRYGNQ8WXF5 182 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 OR8D1Q8WZ84 308 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 FGF11Q92914 225 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 NABP1Q96AH0 204 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 RPEQ96AT9 228 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 CMTM7Q96FZ5 175 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 SMIM10Q96HG1 83 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 POM121L2Q96KW2 1035 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 TSG101Q99816 390 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 TRIM51Q9BSJ1 452 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 HCAR1Q9BXC0 346 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 CALN1Q9BXU9 219 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 ACTR6Q9GZN1 396 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 WDR54Q9H977 334 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 C6orf50Q9HD87 102 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 CTPS2Q9NRF8 586 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 TREX1Q9NSU2 369 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 ZFP57Q9NU63 452 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 RMND1Q9NWS8 449 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 CLN6Q9NWW5 311 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 ATPIF1Q9UII2 106 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 COX11Q9Y6N1 276 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 RAD50Q92878 1312 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 CNTNAP1P78357 1384 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 FHOD3Q2V2M9 1422 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 PLB1Q6P1J6 1458 aa2.06□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 A0A1B0GW55 424 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 PSMB11A5LHX3 300 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 GOLGA8IPA6NC78 632 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 H7C2Y5 167 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 SULT1C2O00338 296 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 MBTPS2O43462 519 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 SGCEO43556 437 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 TRAPPC3O43617 180 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 SCRG1O75711 98 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 GPX5O75715 221 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 RPP14O95059 124 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 RCBTB2O95199 551 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 GJB5O95377 273 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 BRI3O95415 125 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 CATP04040 527 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 TACSTD2P09758 323 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 OCM2P0CE71 109 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 DUX4L2P0CJ85 424 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 DUX4L3P0CJ86 424 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 DUX4L4P0CJ87 422 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 DUX4L5P0CJ88 424 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 DUX4L6P0CJ89 424 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 DUX4L7P0CJ90 424 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 GFAPP14136 432 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 ADORA2BP29275 332 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 OR1D4P47884 311 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 RPL29P47914 159 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 RGS6P49758 472 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 CEBPGP53567 150 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 BIDP55957 195 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 DSCR9P59020 149 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 DSTNP60981 165 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 ACTA2P62736 377 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 ACTG2P63267 376 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 ACTC1P68032 377 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 ACTA1P68133 377 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 SP4Q02446 784 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 BCL2L1Q07817 233 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 C2orf80Q0P641 193 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 TWF1Q12792 350 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 MED21Q13503 144 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 TFDP2Q14188 446 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 GGTLC2Q14390 218 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 TAL2Q16559 108 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 NDUFAF6Q330K2 333 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 TMEM31Q5JXX7 168 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 OLFML2AQ68BL7 652 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 TFAP2EQ6VUC0 442 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 DNM1P46Q6ZS02 220 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 COX15Q7KZN9 410 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 TMEM150AQ86TG1 271 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 LRRTM1Q86UE6 522 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 CARM1Q86X55 608 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 LRRC34Q8IZ02 419 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 MCOLN2Q8IZK6 566 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 ZNF491Q8N8L2 437 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 CCDC112Q8NEF3 446 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 DUSP18Q8NEJ0 188 aa2.05□□□□□ -2.08
ATRX-220ENST00000635865 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa2.05□□□□□ -2.08
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